Aminoacidos

Los aminoácidos
¿Qué es un aminoácido?
Un aminoácido es cualquier molécula que contiene un grupo funcional ácido y un grupo amino . . .
¿Cuál de las siguientes  cuatro moléculas no es un aminoácido?
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Sin embargo, en la naturaleza los aminoácidos que componen a las proteínasno son tan diversos como podríamos imaginar basándonos en la definición anterior.
De hecho, los aminoácidos reportados en las diferentes proteínas son menos de 100 y de entre ellos, 20 son los que forman parte de todas las proteínas y en base a los cuales se sintetizan las proteínas inicialmente.
Los otros aminoácidos que se han observado en las proteínas son el resultado de modificacionesquímicas que sufren algunas proteínas como parte de su proceso de maduración.

Estructura Básica de los Aminoácidos
* Generalidades. De hecho, los 20 aminoácidos comunes forman un conjunto de moléculas con características más restringidas que las de simples aminoácidos.
Para empezar en todos son α-aminoácidos, es decir, el grupo ácido (siempre un carboxilo) y el grupo amino se hallan unidosal mísmo átomo de carbono.

¿Cuál de las siguientes  cuatro moléculas si es un α-aminoácido?
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* Formas estereoquímicas de los aminoácidos
Además, con la excepción de la glicina, en los 19 aminoácidos restantes el carbono-α posee 4 substituyentes distintos y, por tanto,existen dos isómeros ópticos para estos aminoácidos:
El isómero L y el isómero D
Estos isómeros son imágenes especulares entre sí:

El isómero representado en el lado izquierdo corresponde a la forma estereoquímica L (usando como referencia al D-Gliceraldehído).  Esta es la forma que presentan los aminoácidos comunes que encontramos en la gran mayoría de las proteínas.
Aunque esta sea unadiferencia que pudiera parecer trivial, tiene importantes implicaciones cuando se trata de entender los principios que gobiernan la estructura tridimensional de las proteínas.
* La regla del Maíz. Para distinguir un aminoácido L de un aminoácido D, debemos fijarnos en el carbono α, que tiene cuatro sustituyentes formado un tetraedro. luego hay que identificar al hidrógeno unido directamentea éste carbono. Si orientamos este hidrógeno en el espacio, de modo que quede frente a nosotros y exactamente encima del carbono α...

Entonces tendremos los tres átomos restantes que se unen al carbono α distribuidos en un triángulo, es decir, el grupo carbono carbonílico (CO), el nitrógeno amínico (N) y el carbono β que el el primer átomo de la cadena variable (o grupo R). Si leemos el ordende estos átomo, comenzando por el carbonilo y siguiendo la dirección de las manecillas del reloj , se formará la palabra CORN si el aminoácido es L y CONR si el aminoácido es D.
Como en los aminoácidos L la palabra clave es CORN, se conoce a este manera de identificarlos como "la regla del maíz".
¿Cuál de los siguientes amioácidos es un D aminoácido? (y por lo tanto no se encuentra en lasproteínas comunes).
Use el puntero para rotar cada imagen e identificar la respuesta. Si tiene dudas acerca de la identidad de los grupos consulte la estructura de los aminoácidos
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la letra que marca al D-aa. Pique aquí para ver la representación en 3D. || |
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Propiedades de los aminoácidos
Propiedades de los α-aminoácidos
* Propiedades ácido base
Dado que todos los aminoácidos poseen un grupo ácido  (-COOH) y un grupo básico (-NH2), todos los aminoácidos libres presentan características ácido-base. Así, si nosotros titulamos un aminoácido como la glicina, observaremos lo siguiente:

(que es pI)...