Genética de poblaciones

Serie de Genética de Poblaciones y Farmacogenómica.
1. En un estudio se genotipificó el polimorfismo S477X del gen LPL que codifica a la lipoproteína lipasa, esta enzima hidroliza los triglicéridos de las lipoproteínas. El polimorfismo S447X (TCA---TGA) aumenta la actividad de la enzima LPL y los niveles de HDL y por tanto, disminuyen los niveles de triglicéridos. A continuación se muestranlos resultados

CC
CG
GG
Total
Observado
42
127
77
246

A. Frecuencias (F) genotípicas observadas.




B. Frecuencias alélicas





C. La n esperada.





D. Frecuencia genotípica esperada





E. Con los datos anteriores complete una tabla para ver los resultados y poder comparar entre los observados y los esperados.


Genotipo
n (Obs)
F genotípica (obs)n (esp)
F genotípica (esp)
CC
42
0,1707
45
0.1838
CG
127
0.5162
121
0.4897
GG
77
0.3130
80
0.3261

F. En base a estos resultados, ¿considera que la población que usted muestreó está en equilibrio de Hardy-Weinberg? EXPLIQUE.





con 95% de significancia.
H0 = la población está en equilibrio
Criterios:
Si X2 calculada > X2 tablas: entonces se rechaza H0
Si X2calculada < X2 tablas: entonces no se rechaza H0

0.610 < 3.841 por lo tanto H0 se acepta lo que nos dice que la población está en equilibrio
2. La fibrosis quística es una condición autosómica recesiva que afecta a 1 en 2,500 niños en la población caucásica de los EUA. De acuerdo a este dato calcule:
A. La frecuencia del alelo recesivo en la población




B. La frecuencia del alelodominante en la población



C. El porcentaje de individuos heterocigotos (portad8ores) en la población


= 4%



3. Con los siguientes datos del polimorfismo del gen que codifica para la enzima tiopurina metil Tranferasa (TPMT) determine las frecuencias genotípicas y alélicas. Determine las frecuencias esperadas de acuerdo a la ley de Hardy-Weinberg y verifique si la población se encuentraen equilibrio.
TPMT*1/*1= 100
TPMT*1/*3=360
TPMT*3/*/*3= 40
Genotipo
n (Obs)
F genotípica (obs)
n (esp)
F genotípica (esp)
CC
100
0.2
157
0.3136
CG
360
0.72
246
0.493
GG
40
0.02
97
0.194

Frecuencias alélicas

*1 =

*3=
La n esperada
*1/*1=p2
*3/*3= q2
*1/*3= 2pq

Conteste lo siguiente:
1. ¿Cuál es la función de TPMT?
Este gen codifica para la enzimatiopurina S-metiltransferasa que metaboliza xenobióticos a través de la tiopurina S-adenosil-L-metionina como donante de S-metilo y S-adenosil-L-homocisteína como subproducto.











http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/7172

2. Diga a qué vía de metabolismo pertenece y qué tipo de fármacos se metabolizan por esa vía
Fármacos de tiopurina tales como 6-mercaptopurina se utilizan comoagentes quimioterapéuticos.
La TPMT participa en la fase II del metabolismo, la metilación, catalizando la S-metilacion de compuestos aromáticos y heterocíclicos con grupos sulfhidrilo, incluyendo fármacos antineoplásicos como la 6-mercaptopurina (6 MP) y 6-tioguanina (6TG), y el inmunosupresor azatioprina (AZA).http://www.reactome.org/entitylevelview/PathwayBrowser.html#DB=gk_current&FOCUS_SPECIES_ID=48887&FOCUS_PATHWAY_ID=156580&ID=156581
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/7172
http://omim.org/entry/610460

3. Si el alelo *1 tiene actividad normal y el alelo *3 presenta una actividad disminuida del metabolismo. Diga que porcentaje de la población tendría un fenotipo con actividad metabólica intermedia.






4. Se determinó el genotipo paraAPOE en 200 individuos de una población encontrando los siguientes resultados.
Genotipos
n APOE
112 3/3
42 4/3
26 3/2
16 4/4
4 4/2
0 2/2
Total. 200
Conteste lo siguiente:
a. Para qué producto proteico codifica APOE.
Codifica para la apolipoproteina E, la aproteína principal de los quilomicrones, esta se une a su receptor en los...