Ingenieria Genetica
TCGGCGCT AGCCGCGA
TCGACGCT AGCTGCGA
Secuencia EcoRI Secuencia BamHI
EcoRI
BamHI
Sitio BamHISitio EcoRI
Añadir sitios de restricción a los extremos de fragmentos de ADN
dNTP dCTP: DIG (Digoxigenina)
PCR
Desnaturalización
Otra posibilidad es marcar loscebadores
Marcaje de sondas oligonucleotídicas por PCR
DIFERENCIAS ENTRE GENOTECA GENÓMICA GENOTECA DE ADNc
1
2
3
1
2
Pre-ARNm ARNm
1
2
3
AAA AAART1ªc
1
2
AAA AAA
AAA TTT RT-PCR RT12ªc TTT AAA Eslabones
AAA TTT
: Sitio de restricción
TTT AAA
PCR
3 CLONES CON ADN GENÓMICO
2 CLONES CON ADNcEjemplo de RT-PCR.
Análisis de la expresión del mRNA del gen porcino NRAMP1
AA..AA AA..AA
ARNm_2,2 Kb ARNm_1,5 Kb
AA..AA AA..AA RT ARNm
ARNm
ADN1c_2,2 Kb 307pb ADN1c_1,5 Kb PCR con primers específicos a ambos ARNm producto de PCR 307 pb
> 307 pb PCR alelo- específica
Ejemplo de rt-PCR cuantitativa (a tiempo real).Análisis de la expresión de dos mRNAs del gen porcino CD51 por PCR alelo-específica
A2.5F AATTAAGATCTCAAATTCACAGA
Cebadores marcados con fluoróforosCCCTTTGAGAATTAAG…………………………………….ACTGAA 14F A14R
A2.5F: 5’ AATTAAGATCTCAAATTCACAGA 3’ 14F: 5’ CCCTTTGAGAATTAAGACTGAA 3’ A14R: 5’ TACAGGATTGCACCTCTTTC 3’ Tª hibridación: 50ºC
Se mide mediante un fluorímetro el marcajeincorporado a los productos de PCR en relación con el ciclo de PCR.
Individuo 8
Individuo 15
Fluorescencia Fluorescencia
14F/A14R A2.5F/A14R
14F/A14R A2.5F/A14RCiclos
Ciclos
14/14
¿Genotipo del individuo 15?
2,5/14 2,5/2,5
¿Genotipo del individuo 8? 14/2.5 ¿Qué ARNm es más abundante? 2.5
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