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Páginas: 23 (5603 palabras)
Publicado: 21 de noviembre de 2012
El análisis genético de Pinus strobus y Pinus monticola poblaciones de Canadá usando ISSR y marcadores RAPD: Desarrollo de marcadores SCAR genoma específicas
Resumen. Pinus es el género más grande de coníferas, que contiene más de 100 especies y es también el género más extendido en el hemisferio norte. Pinus monticola y P. strobus son dos especies estrechamente relacionadas y de importanciaeconómica en Canadá. Las características morfológicas y alométrico se han utilizado para evaluar la variación genética dentro de estas dos especies, pero estos marcadores no son fiables debido a las variaciones ecológicas. El objetivo del presente estudio fue determinar el nivel de diversidad genética dentro y entre poblaciones canadienses de las dos especies mediante marcadores moleculares y paraidentificar y caracterizar específicas del genoma entre simples repeticiones de secuencia (ISSR) y aleatoria de ADN polimórfico (RAPD) marcadores. El nivel de variación genética entre poblaciones fue mucho menor de P. monticola que P. strobus. Para ambas especies, los valores de la población entre las variaciones fueron menores que la variación dentro de la población. Las poblaciones de P. monticolaestaban más estrechamente relacionados genéticamente a las poblaciones de P. strobus basado en ISSR y análisis RAPD. Seis ISSR y cuatro marcadores RAPD específicos para cualquiera de P. monticola o P. strobus fueron clonados y secuenciados. Primer pares que flanquean las secuencias específicas se han diseñado y marcadores SCAR específicas del genoma de P. monticola y P. strobus se handesarrollado y caracterizado.
Introducción
El género Pinus, perteneciente a la familia Pinaceae, se compone de más de 100 especies por lo que es el género más grande de coníferas, así como, la más extendida en el hemisferio norte (Vidakovic 1991). Su distribución va desde el ártico y subártico al sur de Guatemala, el norte de África e Indonesia. Pines habitan en las regiones tropicales, boreales, asícomo, templadas y montañosas (Vidakovic '1991). Este género se divide en dos grupos taxonómicos; subgénero Pinus strobus y subgénero. La clasificación se basa en la anatomía de la madera, la química secundaria y más recientemente en estudios filogenéticos moleculares (Nkongolo et al. 2002, Grotkopp et al. 2004).
El pino blanco (P. strobus) y el pino blanco occidental (P. monticola) son nativosde la parte norte de América del Norte
y son económica y ecológicamente especies importantes (Nkongolo et al. 2002, Echt et al. 1996, Kim et al. 2003). Estas dos especies fueron una vez predominante en toda la zona oriental y la parte occidental de América del Norte, con respeto. La estructura de la población de ambas especies ha sufrido cambios severos debido a la introducción de la royavesicular del pino blanco (Cronartium ribicola) y también a la tala extensiva. Hasta la fecha, sólo el 0,2% de los naturales de P. strobus y menos del 10% de P. monticola está permanecen de la pre-liquidación está en estas regiones. Esta drástica reducción ha resultado en la distribución fragmentada de P. monticola y las poblaciones de P. strobus (Quinby 2000, Jain et al. 2004).
La variación genética deP. monticola y P. strobus han sido determinadas por morfológica y por marcadores moleculares. Los estudios han demostrado que existen bajos niveles de variación entre las poblaciones y las altas variaciones genéticas dentro de las poblaciones de P. monticola. Estos estudios se basaron en química morfológica, alozimas, y polimorfismo de longitud de fragmentos amplificados (AFLP) análisis (Barnes1967, Kim et al. 2003, Steinhoff et al. 1983).
En P. strobus, los estudios realizados utilizando aloenzimas morfológica, RAPD, y marcadores de microsatélites reveló diferencias significativas entre y dentro de las poblaciones (Beaulieu y Simon 1994, Rajora et al. 1998, Eckert et al. 1981). Para ambas especies, el grado de relación genética entre las poblaciones nunca ha sido determinada....
Resumen. Pinus es el género más grande de coníferas, que contiene más de 100 especies y es también el género más extendido en el hemisferio norte. Pinus monticola y P. strobus son dos especies estrechamente relacionadas y de importanciaeconómica en Canadá. Las características morfológicas y alométrico se han utilizado para evaluar la variación genética dentro de estas dos especies, pero estos marcadores no son fiables debido a las variaciones ecológicas. El objetivo del presente estudio fue determinar el nivel de diversidad genética dentro y entre poblaciones canadienses de las dos especies mediante marcadores moleculares y paraidentificar y caracterizar específicas del genoma entre simples repeticiones de secuencia (ISSR) y aleatoria de ADN polimórfico (RAPD) marcadores. El nivel de variación genética entre poblaciones fue mucho menor de P. monticola que P. strobus. Para ambas especies, los valores de la población entre las variaciones fueron menores que la variación dentro de la población. Las poblaciones de P. monticolaestaban más estrechamente relacionados genéticamente a las poblaciones de P. strobus basado en ISSR y análisis RAPD. Seis ISSR y cuatro marcadores RAPD específicos para cualquiera de P. monticola o P. strobus fueron clonados y secuenciados. Primer pares que flanquean las secuencias específicas se han diseñado y marcadores SCAR específicas del genoma de P. monticola y P. strobus se handesarrollado y caracterizado.
Introducción
El género Pinus, perteneciente a la familia Pinaceae, se compone de más de 100 especies por lo que es el género más grande de coníferas, así como, la más extendida en el hemisferio norte (Vidakovic 1991). Su distribución va desde el ártico y subártico al sur de Guatemala, el norte de África e Indonesia. Pines habitan en las regiones tropicales, boreales, asícomo, templadas y montañosas (Vidakovic '1991). Este género se divide en dos grupos taxonómicos; subgénero Pinus strobus y subgénero. La clasificación se basa en la anatomía de la madera, la química secundaria y más recientemente en estudios filogenéticos moleculares (Nkongolo et al. 2002, Grotkopp et al. 2004).
El pino blanco (P. strobus) y el pino blanco occidental (P. monticola) son nativosde la parte norte de América del Norte
y son económica y ecológicamente especies importantes (Nkongolo et al. 2002, Echt et al. 1996, Kim et al. 2003). Estas dos especies fueron una vez predominante en toda la zona oriental y la parte occidental de América del Norte, con respeto. La estructura de la población de ambas especies ha sufrido cambios severos debido a la introducción de la royavesicular del pino blanco (Cronartium ribicola) y también a la tala extensiva. Hasta la fecha, sólo el 0,2% de los naturales de P. strobus y menos del 10% de P. monticola está permanecen de la pre-liquidación está en estas regiones. Esta drástica reducción ha resultado en la distribución fragmentada de P. monticola y las poblaciones de P. strobus (Quinby 2000, Jain et al. 2004).
La variación genética deP. monticola y P. strobus han sido determinadas por morfológica y por marcadores moleculares. Los estudios han demostrado que existen bajos niveles de variación entre las poblaciones y las altas variaciones genéticas dentro de las poblaciones de P. monticola. Estos estudios se basaron en química morfológica, alozimas, y polimorfismo de longitud de fragmentos amplificados (AFLP) análisis (Barnes1967, Kim et al. 2003, Steinhoff et al. 1983).
En P. strobus, los estudios realizados utilizando aloenzimas morfológica, RAPD, y marcadores de microsatélites reveló diferencias significativas entre y dentro de las poblaciones (Beaulieu y Simon 1994, Rajora et al. 1998, Eckert et al. 1981). Para ambas especies, el grado de relación genética entre las poblaciones nunca ha sido determinada....
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