Proteinas

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1. La figura que aparece en la parte inferior, representa la formula general de un
Aminoácido. Mediante un círculo identifique los grupos funcionales con su nombre
respectivo

Grupo amino cadena lateral grupo carboxilo.

2. ¿Cuál es la función del grupo R del aminoácido?
En la clasificación de aminoácidos encontramos que el grupo R cumpleuna función importante en cada uno de los 20 α-aminoácidos encontrados en las proteínas se puede distinguir por la substitución de los grupos-R en el átomo del carbono-α. Existen dos clases amplias de aminoácidos de acuerdo a si el grupo-R, hidrofóbicos o hidrofílicos.
Los aminoácidos hidrofóbicos tienden a rechazar el ambiente acuoso y, por lo tanto, residen predominantes dentro de lasproteínas. Esta clase de aminoácidos no se ionizan ni participan en la formación de enlaces de H. Los aminoácidos hidrofílicos tienden a interactuar con el ambiente acuoso, están implicados a menudo en la formación de enlaces de H y se encuentran predominantemente en las superficies externas de las proteínas o en los sitios reactivos de las enzimas.
En solución es la naturaleza de los grupos-R de losaminoácido los que dictan relaciones de estructura-función de péptidos y proteínas. Los aminoácidos hidrofóbicos serán encontrados generalmente en el interior de las proteínas protegidos del contacto directo con el agua. Inversamente, los aminoácidos hidrofílicos se encuentran generalmente en el exterior de proteínas así como también en los centros activos de las proteínas enzimáticamente activas. Dehecho, es la misma naturaleza de ciertos grupos-R de los aminoácidos que permiten que las reacciones enzimáticas puedan ocurrir.
El anillo imidazólico de la histidina permite que este acto como un donante o aceptador de protones a pH fisiológico. Por lo tanto, se lo encuentra con frecuencia en el centro activo de las enzimas. Igualmente importante es la capacidad de las histidinas en lahemoglobina de proteger los iones de H+ de la ionización del ácido carbónico en los glóbulos rojos. Es esta propiedad de la hemoglobina que le permite intercambiar el O2 y el CO2 en los tejidos o los pulmones, respectivamente.
3. Clasificar y consultar los pK de los siguientes aminoácidos proteicos.
Nombre | Símbolo | Forma estructural | PK1 | PK2 | PK3 | Clasificación de acuerdo a la cadenalateral |
Glicina | Gli (G) | H – CH –COO NH3 | α-COOH 2.4 | α-NH3 9.8 | Grupo R | Cadena lateral alifática |
Alanina | Ala | CH3 | 2.4 | 9.87 | | Cadena lateral alifática |
Leucina | Leu | (CH3)2 CH CH2 | 2.33 | 9.74 | | Cadena lateral alifática |
Serina | Ser | HOCH2 | 2.2 | 9.2 | Cerca de 13 | Aminoácidos no aromáticos R-hidroxilo |
Metionina | Met | CH3SCH2 CH2 | 2.17| 9.27 | | Cadena lateral con átomos de azufre |
Acido aspártico | Asp | HO2CCH2 | 1.99 | 3.90 | 10.00 | Cadena lateral con amidas |
Glutamina | GLn ( ) | H2NCOCH2 CH2 | 2.2 | 9.13 | | Cadena lateral con amidas |

Lisina | Lys | H2N(CH2)4 | 2.16 | 9.20 | 10.8 | Cadena lateral con grupos básicos |
Fenilalanina | Phe | PhCH2 | 2.2 | 9.44 | | Cadena lateral con gruposaromáticos |
Triptófano | (W) | CH2 NH | 2.43 | 9.44 | | Cadena lateral con grupos aromáticos |
Prolina | Pro | NHCO2H | 1.95 | 10.64 | | Cadena lateral con grupos Iminoacidos |

4. ¿Qué es un enlace peptídico? Esquematícelo con el dipéptido gly-ser
* Este enlace se establece entre el grupo carboxilo (-COOH) del primer aminoácido y el grupo amina (-NH2) del segundo aminoácido. Lacaracterística principal de este enlace radica en que no permite el giro de los elementos unidos por él, por lo que es un enlace rígido. La rigidez de este enlace se debe a que los electrones del doble enlace, que posee el carbono del grupo carboxilo con el oxigeno, se moviliza hacia la unión entre en carbono carboxilo y el nitrógeno del grupo amina.
* Este enlace se forma cuando el grupo amino...
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