Scott freman, otros

PROGRAMA BIOLOGIA MOLECULAR

Teóricas

Docentes: Silvia Moreno y Eduardo Canepa

1.- DNA. Estructura primaria. Bases nitrogenadas. Doble hélice: Análisis de Watson y Crick, propiedades. Formas A, B y Z. Desnaturalización y renaturalización. Similitud y complementariedad. Concepto de Cot1/2. Estructuras secundarias. Topología del DNA: números L, T y W. Superenrollamiento. Topoisomerasas:clasificación y mecanismos de acción. Cromatina. Estructura de nucleosomas.

2.- Replicación: características generales. Mecanismo de la replicación en procariotas. Características del sitio de iniciación. Metilación. Proteínas iniciadoras y regulación. Proteínas auxiliares. Formación del complejo abierto. Acción de la helicasa. Relación con la transcripción. Formación del primosoma.

3.- DNApolimerasas. DNA polimerasas I y III: estructura y actividades enzimáticas. Formación del replisoma. Mecanismo de polimerización. Estructura asimétrica de la holoenzima. Componente catalítico, complejo accesorio y factor de procesividad. DNA polimerasas de eucariotas. Fidelidad de la replicación: mecanismos de control. Telómeros y mecanismo de acción de las telomerasas.

4.- Replicación eneucariotas. Orígenes múltiples de iniciación. Factorías de replicación. Anatomía del origen de replicación en levaduras. Identificación de orígenes. Iniciación de la replicación en eucariotas superiores. Regulación de la replicación. Replicación y ciclo celular: factores de licenciamiento. Ciclinas y proteinquinasas dependientes de ciclinas.

5.- Reparación del DNA. Mutaciones: deleciones, inserciones,sustituciones. Frecuencia de mutación. Flexibilidad adaptativa. Desaminación. Depurinación. Oxidación espontánea. Formación de dímeros. Mecanismos de reparación: reparación por eliminación de bases y por eliminación de nucleótidos. Sistemas de reparación inducibles.

6.- Flujo de la información génica: concepto de gen. Familias de genes. RNA ribosomal (RNAr); RNA de transferencia (RNAt);organización génica .

7.- Estructura de proteínas. Estructura primaria, secundaria , terciaria, cuaternaria. Estructura cristalina. Visualización de la estructura (RasMol). Representación de estructuras. Predicción de estructura. Motivos. Secuencias consenso. Dominios. Homología de secuencias. Modificación post-traduccional. Influencia de las modificaciones sobre la estructura.

8.-Estructuraprimaria del RNA. Enlace fosfodiéster. Estructura secundaria intramolecular e intermolecular : doble hélice, horquillas (stem-loop), apareamientos inestables (wobble) GU.

9.-Transcripción basal. RNA polimerasas I,II,III; homología de secuencias. Promotor : definición, concepto de fuerza. Secuencias consenso. Ubicación de promotores : deleciones, mutaciones puntuales, impronta. Promotores para lasRNA polimerasas I, II y III . Etapas de la transcripción : iniciación, despeje del promotor, elongación, terminación. Sistemas de transcripción in vivo e in vitro. Iniciación en eucariotas : factores de transcripción basales para RNA polimerasas I, II, III; formación de complejo de iniciación; TBP, TAFs. Elongación; mecanismo; procesividad. Terminación.

10.- RNA mensasejor (RNAm). Procesamientode RNAm en eucariotas. Procesamiento en extremo 3 ‘ : corte y poliadenilación. Polieadenilación alternativa. Procesamiento en extremo 5’ : encapuchado (capping). Estabilidad del RNAm : deadenilación y desencapuchado (decapping). Exonucleasas. Secuencias de rápida degradación : AREs. Empalme de exones (splicing). Spliceosoma. RNAs pequeños nucleares (snRNPs). Proteínas SR. Splicing alternativo.Edición. Transplicing.

11.- Regulación de la expresión génica . Estrategias celulares para el control de la expresión génica. Secuencias reguladoras. Factores de transcripción : estructura en dominios ; principales estructuras secundarias involucradas en la interacción con DNA y en la dimerización : dedos de zinc, helice-vuelta-helice, homeodominios, cierre de cremallera de leucina. Factores...