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1. 2. ATP sintasa (complejo V)
ATP sintasa, también llamada complejo V, es la enzima final del proceso de la fosforilación oxidativa. Esta enzima se encuentra en todas las formas de vida yfunciona de la misma manera tanto en procariotas como en eucariotas.
Esta enzima usa la energía almacenada en un gradiente de protones a través de la membrana para llevar a cabo la síntesis de ATPdesde ADP y fosfato (Pi). Las estimaciones del número de protones necesarios para sintetizar una molécula de ATP oscilan entre tres y cuatro,92 93 y algunos investigadores sugieren que las célulaspueden variar esta proporción, para ajustarse a diferentes condiciones.94
  
Esta reacción de fosforilación es un equilibrio, que puede ser cambiado alterando la fuerza protón motriz. En ausencia deuna fuerza protón motriz, la reacción de la ATP sintasa se desplazará hacia la izquierda, hidrolizando ATP y bombeando protones fuera de la matriz a través de la membrana. Sin embargo, cuando lafuerza protón motriz es alta, la reacción es forzada a desplazarse en la dirección opuesta; de izquierda a derecha, permitiendo el flujo de protones en el sentido de su gradiente de concentraciónproduciendo ADP desde ATP.91 Es más, en la cercanamente relacionada proteína H+-ATPasa tipo vacuolar, la misma reacción es usada para acidificar los compartimentos celulares, bombeando protones ehidrolizando ATP
2. Calculos mas exactos indican que, de hecho, la energia liberada cuando se oxida 1 mol de NADH.H+ , es suficiente para la sintesis de 2,5 moles de ATP y no 3 como se considerabaanteriormente. Esos calculos indican tambien que el equivalente de la oxidacion de 1 “mol” de FADH2 es suficiente para la sintesis de apenas 1,5 moles de ATP y no  2 moles de ATP como seconsideraba antes. No obstante, diferentes libros de texto continuan utilizando los equivalentes de 3 y 2 ATP por cada NADH.H+ y FADH2 que es oxidado en la Cadena Respiratoria.