Acidos Nucleicos

A) Cada nucleótido es un ensamblado de tres componentes:
* Bases nitrogenadas: derivan de los compuestos heterocíclicos aromáticos purina y pirimidina.
* Bases nitrogenadas purínicas: son la adenina (A) y la guanina (G). Ambas forman parte del ADN y del ARN.
* Bases nitrogenadas pirimidínicas: son la timina (T), la citosina (C) y eluracilo (U). La timina y la citosinaintervienen en la formación del ADN. En el ARN aparecen la citosina y el uracilo.
* Bases nitrogenadas isoaloxacínicas: la flavina (F). No forma parte del ADN o del ARN, pero sí de algunos compuestos importantes como el FAD.
* Pentosa: el azúcar de cinco átomos de carbono; puede ser ribosa (ARN) o desoxirribosa (ADN). La diferencia entre ambos es que el ARN si posee un grupo OH en el segundocarbono.
* Ácido fosfórico: de fórmula H3PO4. Cada nucleótido puede contener uno (nucleótidos-monofosfato, como el AMP), dos (nucleótidos-difosfato, como el ADP) o tres (nucleótidos-trifosfato, como el ATP) grupos fosfato.

B) Enlaces que unen los componentes de un nucleótido:
La pentosa (beta-D-desoxirribosa) y la base nitrogenada (A, G, T ó C) se unen por un enlace N-GLUCOSÍDICO entre elC1´ de la pentosa y el N9 (si la base es púrica) o el N1 (si es pirimidínica).
Enlace ÉSTER entre dos grupos -OH de la molécula de ácido fosfórico, el grupo fosfato, y del C5´ de la pentosa.

Enlaces que unen los nucleótidos entre sí:
Enlaces 5´-3´ FOSFODIÉSTER entre un grupo -OH, del grupo fosfato unido al carbono 5´de la desoxirribosa de un nucleótido, con otro grupo -OH del carbono 3´ de ladesoxirribosa de otro nucleótido.

Enlaces que unen las dos cadenas de ADN para formar la doble hélice:
PUENTES DE HIDRÓGENO entre las bases nitrogenadas complementarias, A-T (2 puentes) y G-C (3 puentes).
INTERACCIONES HIDROFÓBICAS entre las bases en el interior de la doble hélice.

Enlaces que unen a la doble hélice de ADN con las proteínas (histonas y no histónicas) para elempaquetamiento del ADN eucariota en el interior del núcleo celular:
INTERACCIONES ELECTROSTÁTICAS entre iones con carga opuesta, entre los aminoácidos con carga positiva de las histonas (proteína de carácter básico) y las cargas negativas de los grupos fosfatos de los nucleótidos del ADN.
Interacciones del ADN con proteínas no histónicas.
C) La desoxirribosa, o más precisamente 2-desoxirribosa esun monosacárido de cincoátomos de carbono (pentosa, de fórmula empírica C5H10O4, derivado de la ribosa por pérdida de un átomo de oxígeno en el hidroxilo de 2', y por ello no responde a la fórmula general de los monosacáridos (CH2O)n). Forma parte del ADN.
Es un sólido cristalino e incoloro, bastante soluble en agua. En su forma furanosa (anillo pentagonal) forma parte de los nucleótidos que constituyenlas cadenas del ácido desoxirribonucleico (ADN).
D)
| ADN-A | ADN-B | ADN-Z |
Sentido de giro de la hélice | Dextrógiro | Dextrógiro | Levógiro |
Forma y tamaño | Más ancha y corta | Intermedia | Más estrecha y larga |
Surco mayor | Estrecho, profundo | Amplio, profundidad media | Sin profundidad |
Surco menor | Amplio, no profundo | Estrecho, profundidad media | Estrecho,profundo |
Diámetro de la hélice | 2,55 nm | 2,37 nm | 1,84 nm |
Unidad estructural | Par de bases | Par de bases | Dos pares de bases |
Pares de bases/vuelta | 11 | 10,4 | 12 |
Distancia entre pares de bases | 0,23 nm | 0,34 nm | 0,53 nm (G·C) / 0,41 nm (C·G) |
Paso de hélice o vuelta completa | 2,53 nm | 3,54 nm | 4,56 nm |
Rotación por residuo | 32,7º | 34,6º | –30º |
Inclinación de lospares de bases | 19º | 1,2º | 9º |
Balanceo | 5,9º | -1º | –3,4º |
Alabeo | 15,4º | 11,7º | 4,4º |
Plegamiento del azúcar | E C3'-endo | E C2'-endo | E C2'-endo (pirimidinas) / E C3'-endo (purinas) |
Conformación enlace N-glucosídico | Anti | Anti | Anti (pirimidinas) / Syn (purinas) |
Conformación enlace C4'-C5' | + Sinclinal | + Sinclinal | + Sinclinal (pirimidinas) / Antiperiplanar...