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Formateo
En el ámbito de la informática, se conoce por formateo de disco a aquel proceso que permite el correcto vaciado de un disco duro para realizar posteriores acciones sobre él. También se puede realizar sobre otros elementos informáticos de almacenamiento y existen básicamente dos tipos de formateo: el lógico (el más común) y el físico.
Normalmente, el proceso de formateo se realiza pararevertir un sistema de archivos que por alguna razón se ha vuelto corrupto o peligroso. De tal modo, el formateo permite limpiar aquellos archivos dañinos y recuperar los útiles, pero esto siempre debe realizarse de antemano. Esto es muy común cuando se habla de computadoras o elementos electrónicos infectados con virus que ya se hayan demasiado expandidos.http://www.definicionabc.com/tecnologia/formateo.php#ixzz2yLqpomSd

LAS PARTICIONES PRIMARIAS O LOGICAS:
Estas son las particiones arrancables, es decir desde las que, al prender la computadora arrancaría
El sistema operativo que hubiera en esa partición primaria, solo puede haber una partición primaria
Activa a la vez, (activa significa que será visible para esa computadora, por lo que el resto de
Particiones primarias seráninvisibles, aunque una vez iniciado el sistema operativo mediante
Software se puedan hacer visibles solo seguirá habiendo una como activa).
Solo puede haber 4 particiones primarias por disco duro.
http://pcnovatos.es.tl/Diferencias-entre-particiones-logicas-y-primarias.htm

Master Boot Record (MBR) (Registro de arranque maestro [MBR])
El Registro de arranque maestro se encuentra en el primersector del disco duro. Identifica donde está la partición activa y, posteriormente, inicia el programa de arranque para el sector de arranque de esa partición. El sector de arranque identifica donde se encuentra el sistema operativo y habilita la información de inicio que se cargará en el almacenamiento principal o RAM del equipo. El Registro de arranque maestro incluye una tabla que localiza cadapartición que está presente en el disco duro.
http://www.symantec.com/es/mx/security_response/glossary/define.jsp?letter=m&word=master-boot-record-mbr
LOS SISTEMAS DE ARCHIVOS
Por decirlo de alguna manera el sistema de archivos es como y de qué manera se guardaran
Los archivos en una partición, como se accederá a ellos…
Es decir cuando se habla de formatear un disco duro
(En realidad lo quese formatea es la partición de ese disco) o una partición, lo que se
Hace es, bueno aparte de borrar todo lo que halla, convertirla a un sistema de archivos, también
Hay que tener en cuenta el sistema operativo que se va a usar, porque no todos los sistemas
Operativos pueden escribir datos en todos los sistemas de archivos, por ejemplo Windows 98 solo
Puede manejar particiones en FAT y FAT32,Windows 2000 y XP pueden manejar las FAT y las NTFS y
Linux actualmente maneja todas, pero en NTFS solo puede leer, todavía no puede escribir datos en
ellas, aunque está al caer.

Los sistemas de archivos más típicos son:

Para Windows:
FAT: ya se usa solo en los disquetes.
FAT32: es similar al FAT pero este permite particiones mayores de 2Gb
(=2000Megas), prácticamente solo se utilizaen Windows 95, 98 y Me y porque estos
Windows no pueden funcionar con NTFS.
NTFS: es el sistema de archivos más nuevo para Windows y también el mejor porque
proporciona un nivel de seguridad muchísimo mayor que FAT aparte de que también
es mucho más estable.

También hay sistemas de archivos para Linux, como ext2, ext3, XFS, REISER FS….

Para manejar particiones, es decir crearlas,borrarlas, modificarles el tamaño…
se puede hacer de varias maneras, hay varios comandos de MS-DOS como el
format y el fdisk aunque ya están en desuso y apenas se utilizan, porque solo valen
para FAT, actualmente han evolucionado y se utilizan las herramientas de los
Windows NT (2000, XP y 2003) cuando arrancamos desde el CD de estos sistemas
operativos podremos crear y eliminar particiones, así...