arabidopsis thaliana

Arabidopsis contiene 25 498 genes y además uno de los genomas más pequeños de todas las plantas conocidas. Este genoma está empaquetado en cinco cromosomas y contiene millones de pares de bases,aproximadamente 1/30 del tamaño del genoma del ser humano. A partir del genoma de Arabidopsis será posible, de forma creciente, predecir, predecir, identificar y aislar genes específicos de cualquierplanta.
Genes pares de bases
Arabidopsis thaliana
0.135 x 109
27407
una planta con flores ( angiospermas ) con uno de los más pequeños genomas conocidos enel reino vegetal.

Los avances en la secuenciación, el reensamblaje y anotación del genoma
Desde la secuenciación sistemática se completó a finales de 2000, la secuencia del genoma ha sido objetode varias rondas de montaje, aplicación de parches agujero, y la extensión a regiones unsequenced. Las regiones secuenciado y analizado el genoma de la cubierta ~ 119 Mb (millones de pares de bases)de la secuencia del genoma. El logro más impresionante ha sido extender BAC y YAC contigs adicionalmente en regiones pericentromeric ( Hosouchi et al. 2002 ). El tamaño de la brecha que queda en cadacromosoma, estimó mediante electroforesis en gel, varió entre 4 Mb y 9 Mb, obteniéndose un tamaño total del genoma de ~ 146 Mb. Varios de los nuevos genes también fueron identificados en laheterocromatina pericentromeric. Estas regiones están entre las más ampliamente descrito ( Hall et al. 2002 ) y son un recurso clave para la comprensión y el uso de funciones centrómeros, por ejemplo, para hacerminichromosomes, para la comprensión de las funciones biológicas de las secuencias de la repetición y la forma en que se originan y se mantienen.
El conjunto inicial de los modelos de genes se hagenerado por una combinación de initio algoritmos de investigación genética optimizados ab y los datos de apoyo como EST y la secuencia de ADNc. Esto se llevó a cabo en varios lugares (para la...