Búsqueda de marcadores moleculares en tomate

MASTER INTERUNIVERSITARIO OFICIAL EN
MEJORA GENÉTICA VEGETAL

Desarrollo y utilización de marcadores
moleculares para el genotipado de la
colección de líneas de introgresión de
Solanum lycopersicoides en el fondo
genético del tomate cultivado

María Florencia Cocaliadis
Directora: Ana María Pérez de Castro

FORMULARIO DEPÓSITO TESIS MÁSTER
1er APELLIDO

AUTOR

2º APELLIDONOMBRE

María
Florencia

Cocaliadis

DNI/NIE

x3728421y

1er APELLIDO

UNIVERSIDAD
UNIVERSIDAD
POLITÉCNICA DE
VALENCIA

2º APELLIDO

NOMBRE

Pérez

DIRECTOR
TESIS

de Castro

Ana María

MÁSTER
Mejora genética vegetal

TÍTULO DE LA TESIS

Desarrollo y utilización de marcadores moleculares para el genotipado de la colección
de líneas de introgresión de Solanumlycopersicoides en el fondo genético del tomate
cultivado
Con objeto de ensanchar la base genética de las especies
cultivadas se recurre a las especies silvestres relacionadas. Solanum
lycopersicoides es la especie silvestre más alejada genéticamente
del tomate cultivado (S. lycopersicum), a partir de la cual, ha sido
posible obtener descendencia fértil a través del híbrido
interespecífico. Sehan realizado numerosos estudios que
demuestran su potencial como fuente de variación en programas
de mejora. Un grupo de investigadores desarrolló una colección de
líneas de introgresión (ILs) de S. lycopersicoides en el fondo
genético de la especie cultivada. Dada la isogenicidad entre líneas
con respecto al genoma recurrente, toda la variación genética que
se distingue entre ellas puedeser directamente asociada al
segmento introgresado. Esta población de premejora constituye,
por tanto, una herramienta muy útil para el cartografiado de genes
de interés así como la incorporación rápida de dichas
características en programas de mejora.
RESUMEN

Un importante porcentaje de líneas de la colección, por
problemas de esterilidad, no se puede mantener en homocigosis.
Para elmanejo y evaluación de la colección es necesario disponer
de marcadores moleculares que permitan determinar o confirmar
la presencia de la introgresión en las líneas. Incrementar la
densidad de los marcadores disponibles facilita, por una parte, la
identificación de recombinación en los fragmentos grandes
mantenidos en heterocigosis y, por otra parte, aumenta la
definición en la determinacióndel tamaño de las introgresiones.
El objetivo del presente trabajo fue desarrollar marcadores
de tipo CAPS (Cleaved Amplified Polymorphic Sequence) para
permitir el manejo de la colección de ILs. Además, se pretendía
utilizar los marcadores desarrollados para genotipar líneas
homocigotas para la introgresión, con objeto de conocer la longitud
de dicho fragmento, así como estudiar lasegregación de la

descendencia de líneas heterocigotas con la finalidad de reproducir
la semilla disponible.
Para la consecución del primer objetivo, se emplearon
marcadores CAPS descritos como polimórficos entre tomate y otras
especies silvestres relacionadas, fundamentalmente derivados de
marcadores RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) o
COS (Conserved Ortholog Set). Se realizó laamplificación mediante
PCR de los parentales de la colección ILs, así como, del híbrido
interespecífico entre ambos. Para la búsqueda de polimorfismo se
utilizó una batería compuesta por diez endonucleasas. En 25 de los
44 marcadores probados se obtuvo producto de amplificación para
S. lycopersicoides y S. lycopersicum, así como en el híbrido
interespecífico. Se desarrollaron un total de 14marcadores
polimórficos, 3 de los cuales proceden de polimorfismo hallado en
PCR, mientras que en los 11 restantes el polimorfismo surge tras la
digestión enzimática.
En el genotipado de líneas de la colección se emplearon
marcadores polimórficos desarrollados en este trabajo y algunos
identificados en estudios previos. Se genotiparon nueve líneas de la
colección de ILs. Se estudió la...