Bioinformática

Química Biológica 2110-2104. Microbiología y Técnico de Laboratorio. Año 2012.

Trabajo Práctico Nº 10:
Bioinformática
Operadoras:
• Samanta Carranza

Fecha:
Lunes 4 de Junio de 2012.Objetivos:

Comprender el concepto de Bioinformática y en que consiste
Conocer las características de la Hexoquinasa Saccharomyces cerevisiae

Resultados:
1. ¿La hexoquinasa de Saccharomycescerevisiae es codificada por uno o más genes? ¿Qué ubicación tienen esos genes en el genoma de la levadura?

En la S. cerevisiae hay un gen en el cromosoma VI, que codifica para la isoenzima 1 dela hexoquinasa (HXK1), y otro en el cromosoma VII, que codifica para la isoenzima 2 (HXK2).


En el caso del gen VI que codifica para la isoenzima 1 de la hexoquinasa (HXK1), una proteínacitosólica que cataliza:




Descripción: Isoenzima hexoquinasa 1, una proteína citosólica que cataliza la fosforilación de la glucosa durante el metabolismo de la glucosa, la expresión es más altadurante el crecimiento de las fuentes de carbono -glucosa, la glucosa inducida por la represión implica la Hxk2p.

1 2. ¿Qué conocen los científicos sobre la hexoquinasa 1?
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a) ¿Cuál es el nombrerecomendado para esta enzima? ¿Y el sistemático?
3 El nombre recomendado es EC 2.7.1.1. -Hexoquinasa.
4 El nombre sistemático es ATP;D-Hexosa-6- Fosfotransferasa.
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b) ¿Existe un sinónimo para lahexoquinasa de S. cerevisiae?
6 Sinónimos:
7 • ATP-D-hexosa-6-fosfotrnsferasa
8 • Glucoquinasa
9 • Hexoquinasa A
10 • Hexoquinasa PI
11 • HK
12 • HXK A
13 • Hxk1
14 • ScHXK2

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9 c) ¿Cuáles son los sustratos y productos naturales en la reacción catalizada por esta enzima?
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• ATP + D- Fructosa → ADP + D-Fructosa 6-fosfato


• ATP + D- Glucosa → ADP+ D-glucosa-6-fosfato

• ATP + D- Manosa → ADP + D-manosa-6-fosfato

• D-Glucosa + ATP → D- glucosa -6-fosfato +ADP


d) ¿Requiere cofactores, iones o metales?
Cofactores:
• ATP
• ATP...