Bioinformatica 2

GEN: At1g03850
Nombre: glutaredoxin ATGRXS13
¿En qué cromosomas se encuentra el gen? :
En el Cromosoma 1
¿Cuantos intrones posee?
Posee un Intron
¿Cuántos mutantes con inserciones en el promotorexisten?
Existen 5 mutantes con inserciones en el promotor
Peso molecular predicho de la proteína y numero de aminoácidos
PM: 16365,7
Aá: 150
Dominios funcionales conservados presentes en la proteína¿En qué órgano tiene una alta expresión?
En hojas caulinares, estructura colectiva hojas, cotiledones, flor, hipocótilo, inflorescencia meristemo, pétalo, célula de la planta de esperma, el polen, laraíz, sépalo, estambre, tallo, hoja vascular.
¿Es esperable de acuerdo a la función del gen?
Tiene actividad de transporte de electrones y de proteína disulfuro oxidorreductasa, por lo cual esesperable puesto que estos órganos tienen actividades que involucran la homeostasis celular redox, la respuesta de defensa a los hongos, nitrato de transporte, respuesta a estímulos de citoquinina, respuestaa nitrato y la respuesta al estrés foto-oxidativa.
¿Cuántos homólogos existen en el genoma de Arabidopsis?
13
Elija una línea de mutante insercional y abra el link, se abrirá una página que lemostrara la secuencia que flanquea al borde izquierdo de la inserción. Cópiela
GTTGTGGATAATTATTTCATTTTCATCAAATAATGTAAAAAGGGAGGATTAAAAATCAAA
GCCATAAAGCCCCAGCTTGTCTAAGAGTAGGCACTAAATCACCATTAATATGAGCAGCCATCAGATTTTCCAATCCTCCAAACAACTTTCCTCCTATGTACATCATAGGTAATTTCTCTT
TATCACTTACGATATTGTCGTAGTTGTTGTTGTCTTCTTCACCAATCTCAACCACCACTG
GATTCACGCCATGTGTCAGTAGCAGCCGTTTTGCCACGTGTCCCAAACAACAGCCTCTCCTTGCAAACACCACCACAGCATTCTCCATCACAACTAGGTTGCTTGATCTCTTATTGCTTA
TAGATGTTGGCTTTGGTGATCCTGATGTTAACCATGATAATGATGATGATGATGATGATG
GTTTATCTTCATTCTTT (Length:437)
Actividad 2
Coordenadas de inserción: 977146 - 977614 bp
Actividad3
Se debe diseñar un juego de 3 partidores, donde el primero hibride en el gen, rio arriba de la mutación, otro que hibride dentro de la región mutada y el tercero, dentro del gen río debajo de la...