Bioinformatica
Páginas: 3 (582 palabras)
Publicado: 19 de octubre de 2011
Ejercicios para las bases de datos de proteínas
1. Busca la secuencia de:
a. La Proteasa alcalina de Aspergillus
>sp|P12547|ORYZ_ASPOR Alkaline protease 1OS=Aspergillus oryzae (strain ATCC 42149 / RIB 40) GN=alp1 PE=1 SV=2
MQSIKRTLLLLGAILPAVLGAPVQETRRAAEKLPGKYIVTFKPGIDEAKIQEHTTWATNIHQRSLERRGATGGDLPVGIERNYKINKFAAYAGSFDDATIEEIRKNEDVAYVEEDQIYYL
DGLTTQKSAPWGLGSISHKGQQSTDYIYDTSAGEGTYAYVVDSGVNVDHEEFEGRASKAY
NAAGGQHVDSIGHGTHVSGTIAGKTYGIAKKASILSVKVFQGESSSTSVILDGFNWAANDIVSKKRTSKAAINMSLGGYSKAFNDAVENAFEQGVLSVVAAGNENSDAGQTSPASAPDAI
TVAAIQKSNNRASFSNFGKVVDVFAPGQDILSAWIGSSSATNTISGTSMATPHIVGLSLY
LAALENLDGPAAVTKRIKELATKDVVKDVKGSPNLLAYNGNA
b. La Ciclina B de Schizosaccharomyces pombe
>sp|P10815|CG23_SCHPOG2/mitotic-specific cyclin cdc13 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain ATCC 38366 / 972) GN=cdc13 PE=1 SV=1
MTTRRLTRQHLLANTLGNNDENHPSNHIARAKSSLHSSENSLVNGKKATVSSTNVPKKRHALDDVSNFHNKEGVPLASKNTNVRHTTASVSTRRALEEKSIIPATDDEPASKKRRQPSVF
NSSVPSLPQHLSTKSHSVSTHGVDAFHKDQATIPKKLKKDVDERVVSKDIPKLHRDSVES
PESQDWDDLDAEDWADPLMVSEYVVDIFEYLNELEIETMPSPTYMDRQKELAWKMRGILTDWLIEVHSRFRLLPETLFLAVNIIDRFLSLRVCSLNKLQLVGIAALFIASKYEEVMCPSV
QNFVYMADGGYDEEEILQAERYILRVLEFNLAYPNPMNFLRRISKADFYDIQTRTVAKYL
VEIGLLDHKLLPYPPSQQCAAAMYLAREMLGRGPWNRNLVHYSGYEEYQLISVVKKMINYLQKPVQHEAFFKKYASKKFMKASLFVRDWIKKNSIPLGDDADEDYTFHKQKRIQHDMKDE
EW
c. El factor de inicio de la traducción 2 (eIF2) está formado por tres subunidades (alfa, beta, gamma). ¿De cuáles existen secuencias en la base de datos enhumanos?
Alfa
>sp|P05198|IF2A_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 OS=Homo sapiens GN=EIF2S1 PE=1 SV=3MPGLSCRFYQHKFPEVEDVVMVNVRSIAEMGAYVSLLEYNNIEGMILLSELSRRRIRSIN
KLIRIGRNECVVVIRVDKEKGYIDLSKRRVSPEEAIKCEDKFTKSKTVYSILRHVAEVLE
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1. Busca la secuencia de:
a. La Proteasa alcalina de Aspergillus
>sp|P12547|ORYZ_ASPOR Alkaline protease 1OS=Aspergillus oryzae (strain ATCC 42149 / RIB 40) GN=alp1 PE=1 SV=2
MQSIKRTLLLLGAILPAVLGAPVQETRRAAEKLPGKYIVTFKPGIDEAKIQEHTTWATNIHQRSLERRGATGGDLPVGIERNYKINKFAAYAGSFDDATIEEIRKNEDVAYVEEDQIYYL
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b. La Ciclina B de Schizosaccharomyces pombe
>sp|P10815|CG23_SCHPOG2/mitotic-specific cyclin cdc13 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain ATCC 38366 / 972) GN=cdc13 PE=1 SV=1
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EW
c. El factor de inicio de la traducción 2 (eIF2) está formado por tres subunidades (alfa, beta, gamma). ¿De cuáles existen secuencias en la base de datos enhumanos?
Alfa
>sp|P05198|IF2A_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 OS=Homo sapiens GN=EIF2S1 PE=1 SV=3MPGLSCRFYQHKFPEVEDVVMVNVRSIAEMGAYVSLLEYNNIEGMILLSELSRRRIRSIN
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