Bioinformatica
Páginas: 10 (2378 palabras)
Publicado: 27 de abril de 2012
La bioinformática como herramienta en el descubrimiento de nuevo medicamentos.
Una de las más claras señales del giro de que la biología moderna ha dado es la aparición de la bioinformática, este termino lo ayuda a acuñar Andrew Coulson en la universidad de Edimburgo, misma que fue una de las primeras en crear una unidad de biocomputación en Europa. La bioinformática cobija básicamenteestudios relativos a enfoques sistemicos sobre datos biológicos, no se restringe únicamente a aquellos generados como parte del proyecto genoma, cobija igualmente estudios en ecología con la subsecuente generación de SIGs, pretende brindar una herramienta al biólogo atraves de la cual él pueda afrontar la integración coherente de grandes cantidades de datos, el permitir la organización del conocimientoen si mismo. Hasta el momento su área de mayor desarrollo ha estado ligada a la información proveniente de los distintos proyectos genoma, es así como dentro de las áreas que más apoyo y demanda tienen podemos citar:
1. Bases de datos 2. Software para visualización de estructuras moleculares 3. Sistemas de manejo integrado de laboratorios de R&D a nivel de industria Farmacéutica 4. Software paraestudios de redes genéticas (Genetic Networks) 5. Desarrollo de nuevos algoritmos para estudios de estructura proteica
Las áreas antes mencionadas describen de manera clara el interés general, se tienen grandes cantidades de datos que en si mimos no están dando una idea acerca del comportamiento del sistema como tal, es por ello que dentro del desarrollo de bases de datos (el área de mas y mayorimpacto) se pretende integrar totalmente las distintas fuentes existentes, mediante el desarrollo de interfaces comunes tanto a nivel de usuario final como a nivel de plataformas de desarrollo, un ejemplo claro se tiene en desarrollos tipo SRS (Sequence Retrival System), aquí se pretendió dar una sola y clara manera de consulta y administración de sistemas de bases de datos en Biología molecular.En lo referente a estructuras moleculares y desarrollo de nuevos algoritmos para determinación de ultraestructura la preocupación es palpable tanto en las Universidades como en la Industria Farmacéutica, estos dos puntos tocan de manera directa los procesos de R&D en la búsqueda de nuevos medicamentos. Los estudios que actualmente se llevan a cabo en Redes Genéticas pretenden apartir de genomascompletos dar una idea mas precisa acerca del comportamiento del sistema.
El interés en el uso de computadores para afrontar problemas biológicos empieza a finales de los años 60s y principios de los 70s, primeramente en los laboratorios de los Alamos, dentro del grupo inicial se cuentan nombres como el de Michael Waterman, Temple Smith, Paul Stein y otros, hacia los años 80s se empieza acontar con las herramientas a nivel de laboratorio para generación masiva de datos, y en los años 90 de la mano con la explosión de Internet se da el boom de la Bioinformática como tal. Esta relación no es gratuita, Internet proveyó el canal ideal para el avance de la Biocomputación. Un ejemplo claro de esta provechosa relación se ve en el desarrollo de bases de datos en biología molecular paraconsultas online, en la integración de sistemas de análisis sobre estas mismas bases de datos, sin embargo un ejemplo que muestra como Internet y la Biología in sillico van de la mano lo constituye la aparición de un programa que inicialmente se diseña como un simple visualizador de estructuras moleculares llamado RasMol, y que de la mano del desarrollo de las tecnologías de WEB llega a ser lo que hoypor hoy es... un plug-in que permite que esta visualización se de totalmente on line con todas las posibilidades de su antecesor, a este plug-in se le conoce como CHIME, y permite además total integración con la tecnología JAVA, hasta llegar al desarrollo de una herramienta como el Protein Explorer, que tiene integrados ciertos sistemas de análisis de estructuras proteicas. Tanto RasMol como Chime...
Una de las más claras señales del giro de que la biología moderna ha dado es la aparición de la bioinformática, este termino lo ayuda a acuñar Andrew Coulson en la universidad de Edimburgo, misma que fue una de las primeras en crear una unidad de biocomputación en Europa. La bioinformática cobija básicamenteestudios relativos a enfoques sistemicos sobre datos biológicos, no se restringe únicamente a aquellos generados como parte del proyecto genoma, cobija igualmente estudios en ecología con la subsecuente generación de SIGs, pretende brindar una herramienta al biólogo atraves de la cual él pueda afrontar la integración coherente de grandes cantidades de datos, el permitir la organización del conocimientoen si mismo. Hasta el momento su área de mayor desarrollo ha estado ligada a la información proveniente de los distintos proyectos genoma, es así como dentro de las áreas que más apoyo y demanda tienen podemos citar:
1. Bases de datos 2. Software para visualización de estructuras moleculares 3. Sistemas de manejo integrado de laboratorios de R&D a nivel de industria Farmacéutica 4. Software paraestudios de redes genéticas (Genetic Networks) 5. Desarrollo de nuevos algoritmos para estudios de estructura proteica
Las áreas antes mencionadas describen de manera clara el interés general, se tienen grandes cantidades de datos que en si mimos no están dando una idea acerca del comportamiento del sistema como tal, es por ello que dentro del desarrollo de bases de datos (el área de mas y mayorimpacto) se pretende integrar totalmente las distintas fuentes existentes, mediante el desarrollo de interfaces comunes tanto a nivel de usuario final como a nivel de plataformas de desarrollo, un ejemplo claro se tiene en desarrollos tipo SRS (Sequence Retrival System), aquí se pretendió dar una sola y clara manera de consulta y administración de sistemas de bases de datos en Biología molecular.En lo referente a estructuras moleculares y desarrollo de nuevos algoritmos para determinación de ultraestructura la preocupación es palpable tanto en las Universidades como en la Industria Farmacéutica, estos dos puntos tocan de manera directa los procesos de R&D en la búsqueda de nuevos medicamentos. Los estudios que actualmente se llevan a cabo en Redes Genéticas pretenden apartir de genomascompletos dar una idea mas precisa acerca del comportamiento del sistema.
El interés en el uso de computadores para afrontar problemas biológicos empieza a finales de los años 60s y principios de los 70s, primeramente en los laboratorios de los Alamos, dentro del grupo inicial se cuentan nombres como el de Michael Waterman, Temple Smith, Paul Stein y otros, hacia los años 80s se empieza acontar con las herramientas a nivel de laboratorio para generación masiva de datos, y en los años 90 de la mano con la explosión de Internet se da el boom de la Bioinformática como tal. Esta relación no es gratuita, Internet proveyó el canal ideal para el avance de la Biocomputación. Un ejemplo claro de esta provechosa relación se ve en el desarrollo de bases de datos en biología molecular paraconsultas online, en la integración de sistemas de análisis sobre estas mismas bases de datos, sin embargo un ejemplo que muestra como Internet y la Biología in sillico van de la mano lo constituye la aparición de un programa que inicialmente se diseña como un simple visualizador de estructuras moleculares llamado RasMol, y que de la mano del desarrollo de las tecnologías de WEB llega a ser lo que hoypor hoy es... un plug-in que permite que esta visualización se de totalmente on line con todas las posibilidades de su antecesor, a este plug-in se le conoce como CHIME, y permite además total integración con la tecnología JAVA, hasta llegar al desarrollo de una herramienta como el Protein Explorer, que tiene integrados ciertos sistemas de análisis de estructuras proteicas. Tanto RasMol como Chime...
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