Biologia molecular avanzada

El crecimiento animal y el desarrollo dependen del control preciso de la expresión génica a nivel de transcripción. Un papel central en la regulación de la transcripción de desarrollo se atribuye a factores de transcripción que se unen al ADN potenciador elementos, que a menudo se encuentran lejos de los sitios de inicio de transcripción de genes. En este artículo examinamos los estudiosrecientes que han descubierto importantes funciones reguladoras de la transcripción de desarrollo para los factores de transcripción TFIID basales y de los elementos básicos promotor de ADN que se encuentran cerca de los sitios de inicio de transcripción.
Crecimiento y desarrollo adecuado organismal dependen del momento y el lugar y el nivel de proteína-codificación y regulador de la transcripción degenes de ARN por la ARN polimerasa II (Pol II). Los defectos en estos parámetros de transcripción puede dar lugar a una variedad de fenotipos, incluyendo cambios de destino celular y la letalidad. Así, han dedicado muchos esfuerzos a la determinación de los mecanismos que regulan la transcripción de genes importantes para el desarrollo. Estos esfuerzos se han centrado en los mecanismos que estánmediadas por las secuencias de ADN que actúan en cis y los factores de actuación trans proteínas.
Algunas señales que regulan la transcripción están cableados en genes que ocurren comúnmente a través de elementos de secuencias de ADN genómico que actúan como sitios de unión para la maquinaria de transcripción. Estos elementos se clasifican como potenciador, un promotor proximal, o elementos básicospromotor en base a su ubicación dentro de los genes y sus proteínas de unión correspondiente (Fig. 1A). Enhancer y elementos proximales de promotor están ambos vinculados por secuencias específicas de ADN vinculante proteínas (comúnmente denominadas factores de transcripción), pero estos elementos se encuentran en lugares diferentes con relación al sitio de inicio de la transcripción génica (TSS).La ubicación de los elementos potenciadores varía mucho entre los genes y pueden ser muchos kilobases aguas arriba o aguas abajo de la SAT, mientras que los elementos proximales de promotor son típicamente restringidas a dentro de un par de cientos de pares de bases de la SAT. Por el contrario, los elementos básicos promotor están sujetos a factores de transcripción basal y se encuentran dentrode ~ 100 pb zonas centradas en la SAT. Iniciación de la transcripción por Pol II se dirige, en parte, por la transcripción basal factores TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF TFIIH y que montar en los promotores fundamentales (Thomas y Chiang, 2006). Factores basales de transcripción se llama así porque dirigir un nivel bajo o basal de transcripción in vitro en ausencia de factores de transcripciónadicionales. Esto está en contraste con un nivel superior o activado de la transcripción in vitro que es dirigida por las actividades combinadas de factores de transcripción basal y adicionales. Los estudios bioquímicos indican que los factores de transcripción basal montar en los promotores fundamentales de una manera definida, que comienza con la unión a elementos básicos promotor. El ejemplooriginal y por excelencia es la unión de la proteína de unión a TATA (TBP) subunidad de TFIID al elemento de caja TATA, que nuclea conjunto de TFIIA y TFIIB, seguido por el ensamblaje de TFIIF y Pol II como un complejo pre-ensamblado, y culminando en el montaje de TFIIE y TFIIH.
El impulso detrás de esta crítica proviene de los informes recientes que implican complejos TFIID y elementos básicospromotor como algo vital para la regulación de la transcripción en el desarrollo. Este hallazgo es probable que sea sorprendente para aquellos que no siguen de cerca la literatura transcripción porque la vista de libro de texto es que la regulación de la transcripción de desarrollo está mediada principalmente por factores de transcripción y las secuencias potenciadoras. Para transmitir los nuevos...