BIOQUIMICA DE LAS PROTEINAS

UNIDAD de ÁCIDOS NUCLÉICOS (07/06/2012).

http://www.scribd.com/doc/2678760/Acidos-Nucleicos
http://www.uv.es/tunon/pdf_doc/AcidosNucleicos_veronica.pdf
1. NUCLEOPROTEÍNAS

Sustancias formadas con proteinas combinadas con polimeros naturales de otro tipo los acidos nucleicos  El ejemplo prototípico sería cualquiera de las histonas, que son identificables en las hebras de cromatina. Otrosejemplos serían la Telomerasa, una ribonucleoproteína (complejo de ARN/proteína) y la Protamina. Su característica fundamental es que forman complejos estables con los ácidos nucleicos, a diferencia de otras proteínas que sólo se unen a éstos de manera transitoria, como las que intervienen en la regulación, síntesis y degradación del ADN. dependiendo del tipo de ácido nucleico al que se unan,podemos distinguir entre Desoxirribonucleoproteínas y ribonucleoproteínas. La unión se estabiliza siempre mediante enlaces no covalentes. A esta estabilidad pueden contribuír distintos tipos de interacciones, tanto específicas como no específicas. Las primeras se unirían a secuencias de nucleótidos características, formando enlaces de hidrógeno entre las cadenas laterales de los aminoácidos y losnucleótidos. En el caso de uniones no específicas, la unión se produce entre cargas positivas de los residuos de aminoácido de las proteínas y la cadena polianiónica de fosfato del nucleótido. Un ejemplo de unión específica sería la de las proteínas ribosómicas con el rARN. Las uniones no específicas serían los complejos característicos de los cromosomas, como los que forma la protamina en losespermatozoides de algunos animales.

2. BASES NITROGENADAS (BN)

a. Concepto de BN
Las bases nitrogenadas son compuestos orgánicos cíclicos apolares con fuerte caracter aromatico. Son parte fundamental de los nucleósidos, nucleótidos, nucleótidos cíclicos (mensajeros intracelulares), dinucleótidos (poderes reductores) y ácidos nucleicos. derivan de los compuestos nitrogenados purina de 9 atomosy la pirimidina de 6 atomos pueden existir en 2 formas tautomeras llamada lactama (forma cetonica) y lactima (forma alcoholica)


b. Tipos de BN
Biológicamente existen seis bases nitrogenadas principales (en realidad hay muchas más), que se clasifican en tres grupos, bases isoaloxazínicas (derivadas de la estructura de la isoaloxazina), bases púricas o purinas (derivadas de la estructura dela purina) y bases pirimidinas (derivadas de la estructura de la pirimidina). La flavina (F) es isoaloxazínica, la adenina (A) y la guanina (G) son púricas, y la timina (T), la citosina (C) y el uracilo (U) son pirimidínicas. Por comodidad, cada una de las bases se representa por la letra indicada. Las bases A, T, G y C se encuentran en el ADN, mientras que en el ARN en lugar de timina apareceel uracilo.



b. Estructura química de las BN

Por marcaje isotopico los recursores del anillo de la purina son la glicina, el CO2, el acido aspartico, la glutamina y formas activas de FH4

El anillo de la purina esta compuesto por un anillo pirimidico y un imidazol conjugados y en cambio las pirimidinas solo tienen un anillo pirimidico . De las bases nitrogenadas podemos ver que la unicaque no tiene oxigeno en su estructura es la adenina lo cual le resta capacidad de formar puentes de hidrogeno y la transforma en la base nitrogenada con menor solubilidad en solventes polares como el agua

c. Propiedades químicas de las BN.
1.- Hidrofobia y disposición coplanar de los enlaces
El carácter hidrófobo viene dado por la naturaleza aromática de los anillos purínicos y pirimidínicos.Por tanto, son insolubles en agua a pH fisiológico.; estas interacciones sirven para estabilizar la 
estructura tridimensional de los ácidos nucleico.
Son planas porque los C tienen orbitales moleculares sp2 (tres orbitales moleculares en un plano y uno p perpendicular que sirve para formar el doble enlace). Lógicamente, es una estructura resonante.
2.- Dipolos
Las bases tienen átomos muy...