ccr5

Práctica 5
Pruebas de selección natural
Objetivo:
Evaluar mediante el método SLAC, a través del programa Datamonkey, un grupo de
secuencias nucleotídicas correspondientes al gen CCR5, que presenten selección positiva o
selección negativa mediante la estimación de dN y dS en cada codón, donde dN>dS
representa selección positiva.

Introducción:
CCR5 es un gen que codifica para una proteínacuyo nombre es igual al del gen, CCR5,
ésta es un miembro de la familia de receptores de quimiocinas beta de las proteínas
integrales de membrana (1) y juega un papel importante en el reclutamiento leucocitario en
sitios de inflamación al unirse a las quimiocinas (9), CCR5 se expresa primordialmente en
los linfocitos T, macrófagos, células dendríticas y la microglía. Los ligandos naturales delas quimiocinas que se unen a este receptor son RANTES (RegulateduponActivation,
Normal T-cellExpressed, and Secreted) y proteínas inflamatorias del macrófago (MIPS) 1α
y 1β (también conocidos como CCL3 y CCL4). En los humanos, la ubicación del gen
CCR5 se encuentra en el brazo corto en la posición 21 del cromosoma 3.
En 1984 se planteó que la molécula CD4 es receptor específico para que elvirus
del VIH entrara a la célula(3,4). En 1986 se demostró que la proteína gp120, de la envoltura
viral, se acoplaba al CD4 y ambas moléculas co-precipitaban como un complejo
inmune, demostrando así la unión gp120-CD4.
Se ha encontrado que CCR5 está estrechamente relacionado con el virus del VIH-1 Mtrópico, esto es debido a que la proteína codificada por éste gen, es el correceptor usado porel virus del VIH para ingresar a la célula a través de gp41 (5,6). También se ha encontrado
que cambios en la secuencia nulceotídica o deleciones en la secuencia de CCR5, cambian
de forma importante su conformación y función, resultando en proteínas de CCR5 no
funcionales y con bajo nivel de expresión en la superficie celular (9), como consecuencia a
esto, el virus del VIH no puede reconocera CCR5 e interactuar con éste, y por tanto no
puede ingresar a la célula, confiriendo inmunidad parcial hacia el VIH-1 M-trópico al
hospedero.
Teniendo en cuenta lo anteriormente citado, sabemos que cambios en la secuencia de CCR5
afecta directamente no solo en su estructura, sino también en su función como reclutador
leucocitario en zonas de inflamación, aquí podemos decir que éstasmutaciones son la
entrada a la selección negativa, ya que al afectar la función de la proteína puede resultar en

una mayor susceptibilidad del hospedero ante infecciones a causa de una respuesta inmune
no adecuada, dejándolo con una menor probabilidad de sobrevivencia ante el resto de la
población, sin embargo, actualmente al contarse con antibióticos y nuevos fármacos, estos
individuos nopresentan un riesgo tan alto como lo hubiera sido en otra época, ya que
gracias a los avances en medicina les es posible prevenir, tratar y curar las enfermedades
que puedan adquirir y poder sobrevivir como cualquier otro miembro de la población no
afectada por polimorfismos en CCR5, ya que estas mutaciones en el gen no afectan a una
respuesta inmunitaria efectiva, solo afectan una temprana respuestaante la infección
mediante reclutamiento leucocitario. Además, aquí es donde entra la controversia, ya que
ésta mutación a pesar de estarla considerando como selección negativa a causa de afectar el
roll de CCR5 en una adecuada respuesta inmunitaria, se ha visto que es ventajosa en
individuos infectados con HIV-1 M-Trópico ya que no solo les confiere probabilidad de no
contagiarse, tambiénen caso de contagio se sabe que el virus tarda mucho más tiempo en
hacerse notar y también el hospedero tarda mucho más tiempo en desarrollar SIDA, es aquí
donde podemos decir que puede ser considerada como una mutación con selección positiva,
si es la vemos desde la perspectiva de una población infectados con VIH, ya que de todos
los individuos infectados por VIH solo los portadores de estos...