CIENCIA

Estructura y Función de los ácidos nucleicos
Estructura de los acidos nucleicos

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Estructura secundaria del ADN: Características Principales

Diferencias estructurales del ADN y el ARN
Porque Timina en el ADN y uracilo en el ARN?

Dos cadenas polinucleotídicas
enrrolladas en una doble hélice
dextrógira

H20
La Citosina se deamina espontaneamente
formando Uracilo

Lashebras son antiparalelas

Las enzimas reparadoras reconocen estas
"mutaciones" y reemplazan Us por Cs
NH3

Los esqueletos azucar-fosfato en el
exterior de la doble hélice

Porque 2´-dideoxi en el ADN ?

Pares de base planares a trav és de
puentes de hidrógeno, en el centro
de la estructura
A T (2 H)
GC (3H)

Si no hubiera Timina (5-metil-U) como distinguir las
U normales de lasresultantes de deaminación?

Dos grupos OH en el ARN lo hacen más
suceptible a hidrólisis.

Pares de base separados 3.4 A. Una
v uelta de hebra (3.4 nm) tiene
aprox. 10 pares de base

El ADN sin OH en 2´ es más estable a hidrólisis.

La posición de los esqueletos
azucar-fosfato definen surco mayor
y menor.

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Reglas de síntesis de moléculas informativas

Odio ser una
moléculade
ADN!!

Acidos nucleicos y proteínas

Hay tanta
información
que debo
recordar!!

Formados por un número
limitado de subunidades
Las unidades son
agregadas
secuencialmente formando
cadenas lineales

Flujo de información en
la célula

Cada cadena tiene un
punto de inicio, avanza en
una única dirección y tiene
un punto de finalización
Los productos de la síntesis
primariason modificados
previamente a cumplir su
función

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Reconocimiento de ADN por proteínas

Señales en el ADN

Señales

Donde comienza y termina un gen?
Donde comienza y termina una proteína?

Como leer estas señales?
Legibilidad

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Legibilidad de secuencias de ADN

La estructura de los ácidos nucleicos no es rígida

Accesibilidad a la secuencia
(surcos mayor ymenor)

Enlaces móvil es

Variación con

Enlace N-glicosídico
Enlace Fosfo-di-éster

movimientos de pares de base
Formas alternativas del ADN

Movilidad de las bases
dependiendo de la secuencia v aría el
ángulo entre los pares de base
Ladeado

Giro

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Abertura

Propulsor

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Propiedades fisico-químicas de los ácidos nucleicos
Formas alternativas del ADN
forma Acondiciones de baja humedad
híbridos
ADN- ARN
ARN- ARN
11pb/vta
bases inclinadas
surco mayor profundo
surco menor angosto, mas expuesto

1. Desnaturalización de los ácidos
nucleicos

forma Z
alternancia de purinas y pirimidinas
(CGCGCG)
lev ógira
12 pb/vta
surco mayor muy profundo y cerrado
surco menor muy expuesto

Desnaturalización Parcial del ADN necesaria
para procesos decopiado

Aumento de Temperatura
Regiones ricas en AT se disocian primero

Experimental
Por temperatura
Se analiza mediante espectroscopía
Aumento de Temperatura
Disociación cooperativa de las hebras

Separación de hebras y
formación de ovillos
Tm : un reflejo de la composición promedio de un ADN
Depende del contenido de GC
Tm

Temperatura de disociación
T a la que la mitad del ADNestá disociado

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Denaturalización de los ácidos nucleicos: Tm

2. Renaturalización del ADN

Tm : un reflejo de la composición promedio de
un ADN
Se analiza mediante espectroscopía
Depende del contenido de GC
Tm

Temperatura de disociación
T a la que la mitad del ADN está disociado

Reacción Bimolecular
Encuentro de hebra complementaria
Zipping de complementarias
dependedel tiempo y de la concentración de reactantes

Aplicaciones
Complejidad del genoma
Búsqueda de secuencias específicas

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Reasociación de ADN: complejidad del genoma

Cinética de reasociación del ADN genómico humano

Permite analizar complejidad
de un genoma

Co t1/2 = 1 / k 2

k 2 = constante de segundo orden
Co = concentración de ADN
t1/2 = tiempo medio de reacción...