Cluster Practical Guide Rel1

MONTAJE BÁSICO DE LINUX CLUSTERS
UNA GUÍA PRÁCTICA
Última Actualización: 11 de julio de 2008
Elaborado por: Jorge Zuluaga

Presentación
Esta guía práctica describe la manera como se prepara, monta, instala, configura y prueba un
Cluster Computacional usando nodos que corren el sistema operativo Linux.
El propósito
fundamental de este manual es el de servir como documento de referencia para unejercicio
práctico de instalación de lo que en lo sucesivo llamaremos “Linux Cluster”, que puede ser
utilizado o bien con propósitos didácticos y de entrenamiento o para el despliegue de un Cluster
de Producción.
El manual hace parte de la colección “Guías Prácticas de Computación” desarrollado inicialmente
por el Prof. Jorge Zuluaga con el apoyo del Grupo de Física y Astrofísica Computacional delInstituto de Física de la Universidad de Antioquia y complementado desde Mayo de 2007 a través
del apoyo del Centro Regional de Simulación y Cálculo Avanzado (CRESCA) del que es socio
fundador la Universidad de Antioquia.
La colección de Guías Prácticas esta actualmente formada por esta Guía y una Guía Práctica de
Linux Clustering con Rocks que es la distribución utilizada en el CRESCA. Los manualespueden
descargarse libremente del sitio del Grupo de Física y Astrofísica Computacional
http://urania.udea.edu.co/facom. Especialmente importantes son las actualizaciones que de forma
no regular (dependiendo de las necesidades que surgen en el medio) se realizan de esas mismas
guías.
Esperamos que este documento sea de utilidad para todos aquellos que o bien necesitan utilizar
herramientas comolos Clusters Computacionales para la realización de tareas de computación de
Alto Rendimiento en Ciencias e Ingeniería o para quienes se valen de este conocimiento para
formar estudiantes de Ingeniería o capacitar a personal especializado en el área.
Jorge Zuluaga
Medellín, 2008

Para actualizaciones: http://urania.udea.edu.co/facom – Autor: zuluagajorge@gmail.com

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Convenciones
La guíacontiene una colección de comando útiles, tips de uso, scripts y comentarios generales
sobre un conjunto amplio de tópicos relacionados con el uso y administración de Clusters Rocks.
Se asume en esta guía las siguientes convenciones tipográficas:
Convención

Explicación

Comandos #,#:

Comandos de linux. Todos los
Comando 1,20:
comando vienen numerados de
# ls /var/log/message*
acuerdo a la sesión enla que
aparecen. El nombre del comando se
indica seguido del símbolo del
sistema: '#' cuando el comando debe
ser ejecutado como administrador y
'$' cuando el comando debe ser
ejecutado como usuario. '%' será
utilizado también cuando el comando
pueda ser ejecutado con permisos de
root o de usuario.

# comando

Salida:
salida en pantalla

Archivo:
...
#Configuration file
FILE=configurationSERVER=localhost
...
Descargue: archivo

Ejemplo

Cuando se muestre la salida de un
comando esta se presenta en tipo
courier pequeño.

Salida:

El contenido de un archivo se
presenta en tipo courier con una
sangría respecto al resto del
documento y con una línea vertical
que delimita el contenido del archivo.

./run.sh:

Cuando el documento no esta
completo se colocan puntos
suspensivos arriba o abajoindicando
la presencia de más líneas
Cuando en una situación dada se
requiera un archivo o un paquete
especial se referirá al lector al sitio
del Grupo FACom donde podrá
encontrar el archivo respectivo.

/var/log/messages
/var/log/messages.2
/var/log/messages.4
/var/log/messages.1
/var/log/messages.3

#!/bin/bash
#Script para SGE
#-S /bin/bash
#-j y
dir=/home/fulano/run1
cd $dir
./program.outDescargue: run.sh

El sitio es:
http://urania.udea.edu.co/facom
Y los archivos se encuentran en el
enlace “documentación”

Para actualizaciones: http://urania.udea.edu.co/facom – Autor: zuluagajorge@gmail.com

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Parte 1. Preparación
Las condiciones básicas para crear un Cluster Linux son bastante simples de conseguir e incluso
se cumplen en muchos entornos académicos y corporativos. En esta parte...