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La red aviaria, su posición actual es de gran dinamismo económico, se debe a su tradicional vinculación al sector turístico, punto clave de la economía de la Comunidad Andaluza. Andalucía soporta el 8.6%del tráfico de aeronaves, y el 9.5% en tránsito de pasajeros por esta vía, loque está lejos de satisfacer nuestra significación nacional.
La red marítima es el más económico para lasmercancías de alto volumen a largas distancias, y la función actual de los puertos es la deservir de nodos logísticos para el transporte multimodal de las mercancías por otras vías (carretera y ferrocarril) que las llevarán a su destino final.
El amplio litoral andaluz, su tradición pesquera y las dificultades de comunicación exterior a través de otros medios otorgan a los puertos de Andalucía unahistórica relevancia económica, que continúa en la actualidad.
El medio de transporte marítimo es el más económico para las mercancías de alto volumen a largas distancias, y la función actual de los puertos es la de servir de nodos logísticos para el transporte multimodal de las mercancías por otras vías (carretera y ferrocarril) que las llevarán a su destino final. En 1992 se aprobó la Ley de Puertos delEstado y el ente público Puertos del Estado, que se haría cargo de la administración de los puertos más importantes del país (calificados de interés general) Estos puertos son:
Bahía de Algeciras:
El puerto más importante de Andalucía. Recibe el68% de los buques y del tonelaje de todos los puertos andaluces, y el 17%del total nacional. Es el primer puerto del Mediterráneo en tránsito decontenedores de 6 m, y el 25mundial. En 1999 pasaron por él 4millones de pasajeros, la cuarta parte de todos los puertos nacionales. Tiene en marcha un plan por valor de13.000 millones de pesetas para su ampliación y la mejora de su conexión ferroviaria.
Puerto de Huelva:
Situado en segundo lugar de Andalucía por tráfico de mercancías, es el que cuenta con más superficie terrestre, más grúas y más capacidadde almacenamiento frigorífico
Puerto de Málaga:
Tiene un importante plan de ampliación, su reurbanización e integración con la ciudad. Ocupa el decimotercer puesto en los puertos españoles y es tradicionalmente importador. Se prevé un aumento del tránsito de cruceros turísticos en el futuro.
Bahía de Cádiz:
Comprende las localidades de Cádiz, Puerto Real, Puerto de Santa María y Rota (con unaimportante base militar aeronaval), por lloque ofrece la mayor superficie de depósito y de zona de flotación del sistema portuario andaluz.
Almería-Motril:
Comprende los puertos de las dos localidades y ocupa el puesto decimocuarto en el Rankin español, pero está incrementando considerablemente su cifra de negocios, y constituyen en sus respectivas provincias (Almería y Granada) verdaderos puntosclave de generación de riqueza.
Sevilla:
Único puerto fluvial de España, aprovecha el recorrido navegable del Guadalquivir, con las lógicas limitaciones en el calado de los buques que pueden navegar por esta zona. Su principal actividad es la exportación de productos agrícolas.

Existe una entidad pública llamada "Agencia Pública de Puertos" y que se configura como Agencia Pública Empresarial. Estáadscrita a la Consejería de Fomento y Vivienda.
Corresponde a la Agencia:
El otorgamiento, modificación o extinción de licencias, autorizaciones y concesiones de dominio público portuario en los puertos de gestión directa.
La modificación no sustantiva de las concesiones de obras públicas en materia portuaria.
La redacción y participación en la tramitación de los planes especiales de ordenaciónde los puertos.
La gestión, liquidación y recaudación en período voluntario de las tasas portuarias.
Las revisiones de tasas, excepto las que se correspondan con las concesiones de obras públicas en los puertos de gestión indirecta, previo informe favorable de la Consejería competente en materia de tributos.
Auxiliar a la Consejería competente en materia de puertos en el ejercicio de la...