Deriva genetica

PRACTICA # 4
DERIVA GENÉTICA I
El programa permite trabajar con efectos simulados de Deriva Genética.
Consiste en examinar la probabilidad de que una población iniciada con un tamaño reproductorconocido, alcance un determinado valor de frecuencia alélica.
Por ejemplo, si tenemos una población de tamaño reproductor 18, con frecuencia inicial del alelo “a” q=0.5, podemos evaluar laprobabilidad de que en una (1) generación la frecuencia de q sea tan baja como 0.2, o tan alta como 0.9.
Podemos examinar la probabilidad de que transcurridas 5 generaciones la frecuencia q esté entre 0.1y 0.2 etc., etc.
ETAPA 1
Utilizar valores pequeños de tamaño reproductor. EL MAXIMO ES N=40
Empezar con pocas generaciones: 6 por ejemplo.
La frecuencia inicial puede ser q=0.5

* Laprobabilidad de perder el alelo es de 0.1064767 esto se alcanza con una frecuencia de uno y con una frecuencia de 0 la probabilidad de llegar a este es de 0.1064767.
* Comprobar que si se parte de N=8 yq=0.5, en la generación 8, la probabilidad de fijación del alelo “a” es del 9.9% (mismo valor que la probabilidad de pérdida).
Observar si la probabilidad de que la población alcance unafrecuencia q=0.9 aumenta o disminuye con las generaciones.

* Para fijar el alelo con una frecuencia de 0.5, disminuye con las 8 generaciones, cuando es la frecuencia 1 la probabilidad es de 0.0980264 ycuando la frecuencia es 0 la probabilidad de fijarse es de 0.0980364, la probabilidad de perder el alelo es la misma si aumenta o disminuye, en este caso disminuye.
ETAPA 2
Repetir varias veces conel mismo valor N, pero modificando la frecuencia inicial ‘q’.
N: 8 q: 0.6

* Con el valor de q=0.6 la probabilidad en fijarse el alelo cuando es 0 es de 0.0422551 y cuando se encuentra en 1 laprobabilidad de fijarse el alelo o perderlo es de 0.1972967.
N: 8 q: 0.8

* La probabilidad de fijarse el alelo cuando es 0 es de 0.0072274, y cuando es de 1 se demora para fijarse 0.47602252...