Diagnostico y ROC
Páginas: 8 (1818 palabras)
Publicado: 29 de julio de 2015
SESIÓN PRÁCTICA DE BIOESTADÍSTICA:
EVALUACIÓN DE CRITERIOS
DIAGNÓSTICOS. DISCRIMINACIÓN.
CURVA ROC
OBJETIVOS
Si disponemos de una variable continua (por ejemplo una determinación de un valor
analítico), la selección del valor que diferencia la presencia o ausencia de la positividad
del diagnóstico es importante como referencia en la práctica clínica
La capacidad que tiene una prueba diagnósticade diferenciar entre sanos y enfermos
(positivos y negativos) se denomina DISCRIMINACIÓN. Si disponemos de varias
pruebas para un mismo problema, también es interesante saber cual de ellas es mejor
en esta capacidad.
En esta práctica discutiremos estos conceptos y nos introduciremos en la metodología
de las llamadas curvas ROC (del inglés Receiver Operating Characteristic curves).
Conceptosbásicos
Para poder entender esta práctica, el alumno debe repasar y comprender los siguientes
conceptos:
Recodificación de variables
Sensibilidad y Especificidad de una prueba diagnóstica
Concepto de Tabla de contingencia
Capacidad de Explorar una variable continua
Histograma de una muestra de una variable continua
Estimación de parámetros en la distribución normal
BIOESTADÍSTICA: EVALUACIÓN DECRITERIOS DIAGNÓSTICOS
1
Actividades de preparación de la práctica
Como actividad previa a la realización de la práctica, el alumno debe buscar la siguiente
información:
Leer y entender los capítulos 6 (insistir en páginas 164-168) y 9 (249-257).
Leer los artículos seleccionados y prepara la discusión de los mismos. Buscar
otros artículos que utilicen la misma metodología.
Buscar información teóricasobre las curvas ROC. Recomendamos el
siguiente artículo: Burgueño MJ, Garcia-Bastos JL y Gonzalez-Buitrago JM.
Las curvas ROC en la evaluación de las pruebas diagnósticas. Med Clin
(Barc) 1995; 104:661-670.
Pensar en posibles utilidades reales en la práctica clínica de un médico.
Desarrollo de la práctica
1) Explicación del archivo de datos que emplearemos en la práctica
2) Realizar histogramasy exploración de las variables (Sesión práctica anterior)
3) Recodificar las variables según diferentes puntos de corte (puntos diagnósticos)
elegidos. Las nuevas variables creadas diferencian la positividad de la prueba
según se este por encima o por debajo del punto diagnóstico elegido.
4) Realizar Tablas de Contingencia
5) Realizar los cálculos sobre las Tablas de Contingencia. Sensibilidad,Especificidad, VPP, VPN, VG.
6) Introducir el concepto de DISCRIMINACIÓN
7) Introducir el concepto de Curva ROC y Área bajo la Curva ROC (ABC).
8) Selección del mejor punto diagnóstico (punto de corte óptimo)
9) Comparación de dos curvas ROC
10) Comentar y discutir los artículos elegidos como ejemplos.
11) Simulaciones en el programa de prácticas
12) Discusión global y conclusiones
BIOESTADÍSTICA:EVALUACIÓN DE CRITERIOS DIAGNÓSTICOS
2
Orientación metodológica
Presentación del archivo de datos que emplearemos
El archivo tiene las siguientes características:
BIOESTADÍSTICA: EVALUACIÓN DE CRITERIOS DIAGNÓSTICOS
3
Presentación del primer ejercicio
La determinación de Urea plasmática (variable - urea) medida en mg/dl es un indicador
de la función renal. En este archivo se han recogidolos valores de 504 pacientes. Este
valor de urea puede servir para diferenciar que pacientes presentaran posteriormente
una insuficiencia renal (variable – irenal) (que motivará un tratamiento específico).
La variable Urea puede representarse con este histograma:
80
60
40
20
Desv. típ. = 44.69
Media = 64.8
N = 504.00
0
25
23
21
19
17
15
13
11
90
70
50
30
10
0
0.
0
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0
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00.
0
0.
0
0.
0
0.
0
0.
.0
.0
.0
.0
.0
UREA
Si diferenciamos según presenten posteriormente Insuficiencia renal:
Histograma
Histograma
Para IRENAL= No
Para IRENAL= Si
140
20
120
100
80
10
UREA
Media = 126
N = 94.00
225
184
0
144
180
147
113
80
47
0
Desv. típ. = 46.77
104
N = 410.00
63
Media = 51
23
Desv. típ. = 29.89
20
Frecuencia
40
13
Frecuencia
60
UREA...
EVALUACIÓN DE CRITERIOS
DIAGNÓSTICOS. DISCRIMINACIÓN.
CURVA ROC
OBJETIVOS
Si disponemos de una variable continua (por ejemplo una determinación de un valor
analítico), la selección del valor que diferencia la presencia o ausencia de la positividad
del diagnóstico es importante como referencia en la práctica clínica
La capacidad que tiene una prueba diagnósticade diferenciar entre sanos y enfermos
(positivos y negativos) se denomina DISCRIMINACIÓN. Si disponemos de varias
pruebas para un mismo problema, también es interesante saber cual de ellas es mejor
en esta capacidad.
En esta práctica discutiremos estos conceptos y nos introduciremos en la metodología
de las llamadas curvas ROC (del inglés Receiver Operating Characteristic curves).
Conceptosbásicos
Para poder entender esta práctica, el alumno debe repasar y comprender los siguientes
conceptos:
Recodificación de variables
Sensibilidad y Especificidad de una prueba diagnóstica
Concepto de Tabla de contingencia
Capacidad de Explorar una variable continua
Histograma de una muestra de una variable continua
Estimación de parámetros en la distribución normal
BIOESTADÍSTICA: EVALUACIÓN DECRITERIOS DIAGNÓSTICOS
1
Actividades de preparación de la práctica
Como actividad previa a la realización de la práctica, el alumno debe buscar la siguiente
información:
Leer y entender los capítulos 6 (insistir en páginas 164-168) y 9 (249-257).
Leer los artículos seleccionados y prepara la discusión de los mismos. Buscar
otros artículos que utilicen la misma metodología.
Buscar información teóricasobre las curvas ROC. Recomendamos el
siguiente artículo: Burgueño MJ, Garcia-Bastos JL y Gonzalez-Buitrago JM.
Las curvas ROC en la evaluación de las pruebas diagnósticas. Med Clin
(Barc) 1995; 104:661-670.
Pensar en posibles utilidades reales en la práctica clínica de un médico.
Desarrollo de la práctica
1) Explicación del archivo de datos que emplearemos en la práctica
2) Realizar histogramasy exploración de las variables (Sesión práctica anterior)
3) Recodificar las variables según diferentes puntos de corte (puntos diagnósticos)
elegidos. Las nuevas variables creadas diferencian la positividad de la prueba
según se este por encima o por debajo del punto diagnóstico elegido.
4) Realizar Tablas de Contingencia
5) Realizar los cálculos sobre las Tablas de Contingencia. Sensibilidad,Especificidad, VPP, VPN, VG.
6) Introducir el concepto de DISCRIMINACIÓN
7) Introducir el concepto de Curva ROC y Área bajo la Curva ROC (ABC).
8) Selección del mejor punto diagnóstico (punto de corte óptimo)
9) Comparación de dos curvas ROC
10) Comentar y discutir los artículos elegidos como ejemplos.
11) Simulaciones en el programa de prácticas
12) Discusión global y conclusiones
BIOESTADÍSTICA:EVALUACIÓN DE CRITERIOS DIAGNÓSTICOS
2
Orientación metodológica
Presentación del archivo de datos que emplearemos
El archivo tiene las siguientes características:
BIOESTADÍSTICA: EVALUACIÓN DE CRITERIOS DIAGNÓSTICOS
3
Presentación del primer ejercicio
La determinación de Urea plasmática (variable - urea) medida en mg/dl es un indicador
de la función renal. En este archivo se han recogidolos valores de 504 pacientes. Este
valor de urea puede servir para diferenciar que pacientes presentaran posteriormente
una insuficiencia renal (variable – irenal) (que motivará un tratamiento específico).
La variable Urea puede representarse con este histograma:
80
60
40
20
Desv. típ. = 44.69
Media = 64.8
N = 504.00
0
25
23
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19
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UREA
Si diferenciamos según presenten posteriormente Insuficiencia renal:
Histograma
Histograma
Para IRENAL= No
Para IRENAL= Si
140
20
120
100
80
10
UREA
Media = 126
N = 94.00
225
184
0
144
180
147
113
80
47
0
Desv. típ. = 46.77
104
N = 410.00
63
Media = 51
23
Desv. típ. = 29.89
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Frecuencia
40
13
Frecuencia
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UREA...
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