Diferenciación genética de Botrytis cinerea involucradas en la pudrición gris

Diferenciación genética de Botrytis cinerea involucradas en la pudrición gris
Problemática de estudio:
En el Valle Central de Chile, las frutas de exportación como la uva y la frutilla presentan un problema de pudrición, es decir, quedan cubiertas por un moho de aspecto polvoroso. Este moho gris provoca considerables pérdidas económicas en la actividad agrícola (principalmente en frutas); poresto, es considerado el patógeno de la uva más importante que afecta el país. El causante de esta enfermedad es Botrytis cinerea. Es un moho ascomycete polífago (puede degradar varios compuestos que están presentes en la naturaleza, en las frutas y en algunos vegetales) y que actúa como fitopatógeno en forma necrotrófica (es capaz de atacar en forma activa los tejidos de las células vivas).También actúa como saprófito y como patógeno y ha desarrollado una resistencia a la mayoría de los fungicidas usados para su control, problema grave. Además, tiene la capacidad de atacar a más de 200 hospederos distintos como frutas, berries, hortalizas, flores y cultivos anuales. Por el hecho de que ataca uvas, arándanos, frambuesa o berries de exportación se le considera el principalproblema para la exportación de frutas en Chile y este es el motivo por el cual es de suma importancia conocer más de este moho.

Objetivo:
Describir y conocer los estudios realizados de la genética de Botrytis cinerea.

Desarrollo investigación:
Debido a la variedad de especies que ataca la Botrytis cinerea se investigó la genética de la especie, analizándose las poblaciones existentes enchile. Para realizar esta investigación se utilizan distintas herramientas moleculares, una de estas técnicas es detectar la presencia de transposones. Botritys cinerea presenta dos transposones: uno pequeño llamado Flipper de 2 kb y el otro llamado Boty que es mucho más largo y presenta 2 ltr en sus extremos. La presencia de estos transposones permitió definir genotipos: un genotipo transposa quetiene los dos transposones, un genotipo vacuma que no tiene ninguno de los dos y un genotipo Boty que posee uno de los dos. Los estudios filogenéticos del 97 demostraron que transposa era el grupo que preponderaba en uva en Francia y vacuma era el que estaba en menor proporción. En el 2002 se identificó el gen HCH que se relaciona con la incompatibilidad entre micelios; en esta se encontraron dosalelos y la diferencia entre ellos era que eran susceptibles a un sitio de corte de una enzima hc1, existiendo dos perfiles de restricción un perfil 1 y un perfil 2 y encontraron que Botrytis en Francia se podía dividir en 2 grupos; un grupo mayoritario que tenía el perfil 2 y un grupo minoritario con el perfil 1, encontrándose en el grupo 1 aislados de vacuma, mientras el grupo 2 presentó aisladosde transposa. También se realizó un estudio filogenético con 4 genes distintos para determinar las relaciones filogenéticas en estos dos grupos y se observó la formación de cluster filogenéticos distintos de Botrytis, generándose como conclusión que son especies distintas.
En Chile se investigó si existían diferencias de Botrytis según el tipo de hospedero y se recolectó tomate, kiwi y uva dela región central y se compararon con arándanos de la zona sur, utilizándose para ello distintos partidores y realizando un PCR dúplex para observar la presencia de los dos transposones (vacuma y transposa). Se encontró que aparecían ligamientos que contenían uno de los dos transposones, esto se confirmo después con PCR específico y se encontró el transposón Boty, lo cual no había sido descrito enFrancia. Y se observó que en uva existía mayormente vacuma, con una pequeña fracción de Boty; lo mismo ocurre en tomate y arándano. Como no se tenían marcadores específicos como microsatélites se utiliza un ensayo RAPD que es por amplificación de fragmentos al azar por PCR, esto consiste en pegar el primer en distintas regiones del genoma y luego se produce la amplificación la polimerasa...