Diseño de fármacos. Interacciones DNA-proteínas

 5. INTERACCIONES PROTEÍNA-ÁCIDO NUCLEICO

1. Interacciones proteína-ac. nucleico
Aunque las estrategias racionales e irracionales (SBD y HTS) han conducido al descubrimiento de numerososinhibidores enzimáticos, no hay que olvidar que muchas de las potenciales dianas moleculares no son enzimas. Una de las estrategias que permite modular la función de estas proteínas no enzimáticas es ladisrupción de las interacciones proteína-macromolécula. La identificación de compuestos que influyen tanto en las interacciones proteína-proteína como en las proteína-ac. nucleico es bastante difícil, yaque los métodos de análisis no son demasiado buenos.
Los ac. nucleicos cumplen funciones esenciales a nivel celular: almacenamiento de la información, replicación, transcripción y traducción. Noobstante, la tasa de éxito que se consigue en torno al análisis de las interacciones proteína-ac. nucleico es bastante baja, ya que hasta ahora se pensaba que las características estructurales de los ac.nucleicos no eran tan complejas como las de las proteínas, y por lo tanto existía poca información sobre ellas. Sin embargo, hoy en día se ha visto que estas moléculas son capaces de adquirirestructuras muy complejas y dinámicas.
Debido a esta falta de información estructural, durante mucho tiempo se ha creído que, en contra de lo que sucede con las interacciones enzima-substrato oproteína-proteína, las interacciones proteína-ac. nucleico no se podían inhibir. No obstante, varias publicaciones han demostrado que esto no es así, lo que abre la puerta hacia la posibilidad de inhibir elfuncionamiento de proteínas que participan en procesos como replicación, reparación o recombinación del DNA.
Además de estas proteínas, resultan de especial relevancia los factores de transcripción (TF), loscuales se unen a regiones específicas del DNA y regulan la expresión génica, lo que conduce a la transcripción de dichos genes y la síntesis de nuevas proteínas. La activación de los TFs está...