Diseño de iniciadores de PCR






Debido a que las bacterias patógenas Campylobacter jejuni y Campylobacter colison son las causantes de importante enfermedades intestinal en los ser humanos y el síndrome de Guillain-Barré (GBS), así como el aborto séptico en las ovejas y ganado, es de gran importancia su estudio. Se menciona que los métodos de cultivo tradicionales de estos patógenos es demasiado tardío, se hace usode herramientas bastante efectivas como la PCR para la obtención rápido de información cualitativa útil para la formulación de un tratamiento efectivo contra estas bacterias.

El uso de iniciadores oligonucleótidos para la extracción de DNA de Campylobacter jejuni y Campylobacter colison por medio de PCR multiplex fue la estrategia utilizada.

Se utilizó:
Tras cultivo en agarMueller-Hinton a 37 º C en
microaeróbica ambiente durante 48 h: C. jejuni NCTC 11168, C. jejuni
NCTC 11828, C. jejuni NCTC 11322, C. coli NCTC 12110, C. coli
NCTC 11437, C. coli NCTC 11350, C. coli NCTC 11366, C. coli
NCTC 11438 y C. coli UA585.





•.

primer
secuencia
bases
GC %
Tm
ΔG

GTGTAATCATCACCACATTTGATA
24
33.33
55.26
0.33

TATAGGTTCTCGTGTAGCAATGCT
24
41.67
59.66
0.26GGATCCATCACAGCCTTATCACTCAAGTGTC
31
48.39
66.64
-1.69

GATATGCAAGGAAATATCCTAGGTC
25
40.00
56.91
-2.13


VAC1 5`GTGTAATCATCACCACATTTGATA3`



VAC2 5`TATAGGTTCTCGTGTAGCAATGCT3`

SADC1 5`GGATCCATCACAGCCTTATCACTCAAGTGTC3`









SADC2 5`GATATGCAAGGAAATATCCTAGGTC3`


Homer-dimer

VAC1 5`GTGTAATCATCACCACATTTGATA3`
Delta G
-5 kcal/mole
Base Pairs
4


  5' GTGTAATCATCACCACATTTGATA
         ||||          ::::     
 3'     ATAGTTTACACCACTACTAATGTG






Delta G
-5 kcal/mole
Base Pairs
4



 
 5' GTGTAATCATCACCACATTTGATA
            ||||       ::::        
 3'        ATAGTTTACACCACTACTAATGTG






Delta G
-3.42 kcal/mole
Base Pairs
3



 
 5'  GTGTAATCATCACCACATTTGATA
      :  |||         :::  :   3' ATAGTTTACACCACTACTAATGTG






Delta G
-3.3 kcal/mole
Base Pairs
3



 
 5'            GTGTAATCATCACCACATTTGATA
               |||       :::           
 3' ATAGTTTACACCACTACTAATGTG






Delta G
-3.3 kcal/mole
Base Pairs
3



 
 5'         GTGTAATCATCACCACATTTGATA
            |||          :::        
 3' ATAGTTTACACCACTACTAATGTG






Delta G
-3.3 kcal/moleBase Pairs
3



 
 5'       GTGTAATCATCACCACATTTGATA
           |||  : :: :  :::       
 3' ATAGTTTACACCACTACTAATGTG






Delta G
-1.95 kcal/mole
Base Pairs
2



 
 5'               GTGTAATCATCACCACATTTGATA
                   ||    ::               
 3' ATAGTTTACACCACTACTAATGTG






Delta G
-1.95 kcal/mole
Base Pairs
2



  5' GTGTAATCATCACCACATTTGATA
               : || :: :: :           
 3'           ATAGTTTACACCACTACTAATGTG






Delta G
-1.95 kcal/mole
Base Pairs
2



 
 5' GTGTAATCATCACCACATTTGATA
                   ||  ::               
 3'             ATAGTTTACACCACTACTAATGTG






Delta G
-1.94 kcal/mole
Base Pairs
2



 
 5' GTGTAATCATCACCACATTTGATA
        ||   :    :   ::     3' ATAGTTTACACCACTACTAATGTG






Delta G
-1.47 kcal/mole
Base Pairs
2



 
 5'             GTGTAATCATCACCACATTTGATA
                   : || :               
 3' ATAGTTTACACCACTACTAATGTG






Delta G
-1.47 kcal/mole
Base Pairs
2



 
 5'          GTGTAATCATCACCACATTTGATA
               :: || :: ::           
 3' ATAGTTTACACCACTACTAATGTG






Delta G
-1.47 kcal/moleBase Pairs
2



 
 5' GTGTAATCATCACCACATTTGATA
            ||      ::        
 3'   ATAGTTTACACCACTACTAATGTG






VAC2 5`TATAGGTTCTCGTGTAGCAATGCT3`
Delta G
-6.69 kcal/mole
Base Pairs
4


 
 5' TATAGGTTCTCGTGTAGCAATGCT
                   |||| ::::               
 3'                TCGTAACGATGTGCTCTTGGATAT






Delta G
-3.61 kcal/mole
Base Pairs
2...