Diseño De Farmacos

Introducción al diseño de Fármacos
J.C. Escalona, R. Carrasco, J. A. Padrón
Folleto para la docencia de la asignatura de Farmacia, Universidad de Oriente.

INDICE
I.

Introducción _________________________________________________ 1

II

Capítulo I. Diseño de Fármacos. Métodos Tradicionales. _____________ 4

II.1

Métodos Variacionales _______________________________________

II.1.1

Búsqueda delcompuesto líder o cabeza de serie ____________________ 5

II.1.2

El desarrollo de un compuesto líder: La variación molecular. __________ 6

II.1.3

Método Variacional. Tipo de aplicación. __________________________ 8

4

II.1.3.1 Sustitución bioisostéricas ______________________________________ 8
II.1.3.2 Modulación Molecular ________________________________________ 9
III.

Capitulo II. Diseño defármacos asistido por computadoras. ___________ 12

III.1

Técnicas SAR o modulación molecular en el desarrollo de nuevos
Fármacos. __________________________________________________ 12

III.1.1

Búsqueda del farmacóforo. _____________________________________13

III.1.1.1 Búsqueda del farmacóforo cuando no se conoce la estructura del
receptor.____________________________________________________13
III.1.1.2 Búsqueda del farmacóforo cuando se conoce la estructura del receptor. ___14
III.1.2

Consideraciones finales. ________________________________________ 16

III.2

Técnicas QSAR en el desarrollo de nuevos fármacos. _________________ 17

III.2.1

Elección de la serie. ___________________________________________ 19

III.2.2

Tipos de estudios QSAR. _______________________________________20

III.2.2.1 QSAR Tradicional. ____________________________________________ 20
III.2.2.2 QSAR por redes de neuronas. ____________________________________
III.2.2.3 QSAR tridimensional (3D-QSAR). ________________________________
III.2.3

Validación del modelo. __________________________________________

III.2.4

Descriptores moleculares o índices. ________________________________

III.2.4.1 Indicesbasados en propiedades químico-físicas. ______________________
III.2.4.2 Indices mecánico-cuánticos. ______________________________________
III.2.4.3 Indices topológicos y topográficos. _________________________________

III.2.5

Criterios de selección de parámetros. _______________________________

III.2.6

Situción actual y tendencias futuras. ________________________________

I.INTRODUCCION

La historia del medicamento se remonta a los orígenes de la sociedad humana. Desde
los primeros tiempos el hombre a acudido a la naturaleza para obtener sustancias que o
bien le ayudaran a paliar su dolor, los síntomas de sus enfermedades... o bien le
facilitaran la obtención del alimento (veneno para la caza), sus relaciones sociales y
religiosas (estimulantes y alucinógenos) etc. Estacircunstancia ha permitido disponer de
una amplia información, que sometida a la observación atenta y estudio crítico, ha dado
lugar al planteamiento de ideas que, debidamente desarrolladas, han llevado a la
obtención de nuevos medicamentos, de sustancias líderes. Esta historia previa es la
causa de que en la actualidad el modelo de aproximadamente la mitad de los productos
de que se dispone sea de origennatural. Modelos que, obtenidos a partir de un
organismo vivo, han sufrido diferentes modificaciones en el laboratorio, encaminadas a
obtener moléculas más potentes y menos tóxicas que las originales, las cuales en
realidad no habían sido diseñadas para un tratamiento específico.
El descubrimiento de un nuevo medicamento y desarrollo posterior del mismo, son dos
fases, que condicionan lograr unnuevo producto que sea útil en la terapéutica.
El descubrimiento debe ser diferenciado del desarrollo. Se ha acordado de manera
general que el descubrimiento comprende toda la fase para que podamos asegurar que el
compuesto tiene un deseable perfil de actividad; comprende desde la síntesis, el
aislamiento de la fuente natural, o la obtención biotecnológica y toda la fase preclínica,
incluida la...