Diseño por computadora de fármacos reconocedores de surco
Páginas: 3 (735 palabras)
Publicado: 1 de septiembre de 2014
“DISEÑO POR COMPUTADORA DE FÁRMACOS
RECONOCEDORES DE SURCO DE DNA”
Rafael Contreras Chávez, Facultad de Químico Farmacobiología (UMSNH). Chatibolo01@hotmail.com. Asesor D.C Luis Chacón García,Instituto de
Investigaciones Químico Biológicas (UMSNH). lchacon@umich.mx
PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA
Existen enfermedades en las cuales están implicadas modificaciones en el
ácidodesoxirribonucleico, compuestos que son caracterizados por su
actividad farmacológica son los que interactúan con el DNA, los cuales
tiene un uso potencial como agentes citotóxicos o antibacterianos. Por sumecanismo de acción molecular, pueden clasificar como agentes que
interactúan covalentemente con el material genético y aquellos que lo
hacen de manera reversible mediante interacciones intermolecularesdébiles. Los últimos a su vez, se subdividen en intercaladores y en
reconocedores de surco (RS) dependiendo del tipo de interacción con el
DNA. Los RS (Fig.1), están sujetos a los principios básicosde la
termodinámica, de tal manera que la energía requerida para su interacción
se define por la Ecuación ∆𝐺 = ∆𝐻 − 𝑇∆𝑆. Por lo cual se convierten en
excelentes objetivos en el tratamiento deorigen contra estas
enfermedades.¹
METODOLOGÍA
Base
de
Datos
Se tomó una serie de 27 compuestos reconocedores de surco de DNA
complementarios al dodecámero de Dickerson Drew (DDD)¹ y la Tmque
inducen en el DNA se obtuvieron de la literatura. La optimización
geométrica de cada estructura se llevó a cabo con el programa Hyper
Chem®. Las estructuras inicialmente fueron modeladas pormecánica
molecular y posteriormente se optimizó su geometría mediante el
método semiempírico AM1. Para la optimización geométrica se tomó
como base el algoritmo Polak-Riviere con parámetros de 0.1 kcal/(Å
mol). Se procedió a obtener 1664 descriptores moleculares para cada
uno de los compuestos, agrupados en 20 familias, con ayuda del
programa DRAGON®. Los valores de cada descriptor fueron...
RECONOCEDORES DE SURCO DE DNA”
Rafael Contreras Chávez, Facultad de Químico Farmacobiología (UMSNH). Chatibolo01@hotmail.com. Asesor D.C Luis Chacón García,Instituto de
Investigaciones Químico Biológicas (UMSNH). lchacon@umich.mx
PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA
Existen enfermedades en las cuales están implicadas modificaciones en el
ácidodesoxirribonucleico, compuestos que son caracterizados por su
actividad farmacológica son los que interactúan con el DNA, los cuales
tiene un uso potencial como agentes citotóxicos o antibacterianos. Por sumecanismo de acción molecular, pueden clasificar como agentes que
interactúan covalentemente con el material genético y aquellos que lo
hacen de manera reversible mediante interacciones intermolecularesdébiles. Los últimos a su vez, se subdividen en intercaladores y en
reconocedores de surco (RS) dependiendo del tipo de interacción con el
DNA. Los RS (Fig.1), están sujetos a los principios básicosde la
termodinámica, de tal manera que la energía requerida para su interacción
se define por la Ecuación ∆𝐺 = ∆𝐻 − 𝑇∆𝑆. Por lo cual se convierten en
excelentes objetivos en el tratamiento deorigen contra estas
enfermedades.¹
METODOLOGÍA
Base
de
Datos
Se tomó una serie de 27 compuestos reconocedores de surco de DNA
complementarios al dodecámero de Dickerson Drew (DDD)¹ y la Tmque
inducen en el DNA se obtuvieron de la literatura. La optimización
geométrica de cada estructura se llevó a cabo con el programa Hyper
Chem®. Las estructuras inicialmente fueron modeladas pormecánica
molecular y posteriormente se optimizó su geometría mediante el
método semiempírico AM1. Para la optimización geométrica se tomó
como base el algoritmo Polak-Riviere con parámetros de 0.1 kcal/(Å
mol). Se procedió a obtener 1664 descriptores moleculares para cada
uno de los compuestos, agrupados en 20 familias, con ayuda del
programa DRAGON®. Los valores de cada descriptor fueron...
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