Distancia de similaridad

Medidas de similaridad y distancia
Capítulo 6 de McCune y Grace 2002, y páginas 37-44 de Ruokolainen et al. 2004

Similaridad en composición de las comunidades o unidades de muestra
EspeciesParcela1 Parcela2 Parcela3

A
5 28 0

B
3 12 0

C
2 0 15

Composición, similaridad y distancia (o disimilaridad)

Espacio de especies

Espacio de muestras

Medidas de distancia
•Categorías:
– Métricas:
• • • • Distancia es 0 cuando los objetos son idénticos Cuando son distintos la distancia es positiva Distancia entre A y B = distancia entre B y A Distancia entre 2 de 3objetos no es > que la suma de las otras 2 distancias (axioma de la desigualdad del triángulo)

– Semimétricas: puede violar el 4to criterio – Nométricas: viola uno o más de los otros criteriosMedidas de distancia multidimensional
• Distancia euclidiana
– Versión multidimensional del Teorema de Pitágoras: c2 = a2 + b2 c = √ a2 + b2
Distancia euclidiana =

Species 1

Distancia a lo largode bloques de ciudad
• Ecuación general:

Species 1

Coeficientes de proporciones
• Estos se pueden convertir a medidas de distancia a lo largo de bloques.
– Coeficiente de Jaccard –Coeficiente de Sorensen

Similaridad Jaccard
• Jaccard para presencia/ausencia • Jaccard = • Jaccard = spp compartidas / total spp • Jaccard cuantitativo (incluyendo abundancia de especies)

SimilaridadSorensen
• Sorensen para presencia/ausencia • Sorensen = • Sorensen cuantitativo (como distancia):

Distancia Chi cuadrada
• Problemática porque da mucha importancia a especies con pocaabundancia. • Utilizada en programas de multivarianza bien populares (e.g., DCA, CCA) • Distancia Chi cuadrada:

Desempeño de medidas de distancia
• Si las especies responden a su ambiente, una gráfica dedistancias entre comunidades debe reflejar un patrón lineal a lo largo del gradiente ambiental principal

Desempeño de medidas de distancia: euclidiana
Beta baja Beta alta

Desempeño de...