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Así como todo el complejo de Golgi tiene su parte cis y su parte trans, cada sáculo aplanado también tiene su cara cis y su cara trans. En general las caras cis son caras formadoras y es la parteque está más cerca a la envoltura nuclear o un retículo endoplasmatico, y en general las caras trans son las caras que están más alejadas más distales estas caras están en vías de maduración.
Las carascis son recetores de las vesículas, la vesícula es recibida por la cara funcionan membranas y descargan su contenido en el interior, en la cara trans se genera unos mecanismos de gemación que daorigen a una vesícula con el contenido que tenía adentro la cisterna y esta vesícula va a viajar a una nueva cara cis y el proceso se repitiera y así sucesivamente hasta atravesar desde la parte cis hastala parte trans. Este es el funcionamiento básico
Los sistemas también tienen determinadas funcionalidades en la parte Cis Golgi ocurre la fosfoliracion de proteínas y de ogliglo sicarios, en laparte de Golgi medial se adicionan residuos de azucares y en el trans Golgi ocurre destrucción de proteínas, clasificación de proteínas y lípidos, adicción de residuos de azúcar ect. Y luego el transGolgi libera todo el contenido hacia la membrana plasmática a vesículas especiales o a vesículas de secreción
Parte de las moléculas recibidas desde el Retículo Endoplasmático a la Red Cis Golgi sondevueltas a través del llamado transporte retrógrado o de recuperación. La función de dicho transporte es tanto el retorno de moléculas que han escapado del RE, moléculas residentes que quedaronatrapadas en las vesículas de COPII, como el reciclaje de membrana. De la misma manera que en el tráfico intra-Golgi, la proteína COPI media la vía de transporte retrógrada. Los compuestos del ER que debenser devueltos contienen señales que los unen a las cubiertas de COPI, empaquetándose y formando el contenido de la vesícula de transporte. Una de las señales mejor caracterizada es la secuencia KKXX...