Ecologia Molecular

Herramientas moleculares
aplicadas en ecología:
aspectos teóricos y prácticos

Herramientas moleculares
aplicadas en ecología:
aspectos teóricos y prácticos
Amelia Cornejo Romero, Alejandra Serrato Díaz,
Beatriz Rendón Aguilar, Martha Graciela Rocha Munive
(compiladoras)

Secretaría de Medio Ambiente y Recursos Naturales (Semarnat)
Instituto Nacional de Ecología y Cambio Climático (INECC)Universidad Autónoma Metropolitana-Iztapalapa (UAM-I)

Primera edición: julio de 2014

D.R. © Secretaría de Medio Ambiente y Recursos Naturales

Blvd. Adolfo Ruiz Cortines 4209. Col. Jardines en la Montaña
C.P. 14210. Delegación Tlalpan, México, D.F.
www.semarnat.gob.mx
Instituto Nacional de Ecología y Cambio Climático (INECC-Semarnat)
Periférico Sur 5000. Col. Insurgentes Cuicuilco
C.P. 04530.Delegación Coyoacán, México, D.F.
www.inecc.gob.mx

D.R. © Foto de portada: Bill Frymire

ISBN: 978-607-8246-72-4
Impreso y hecho en México

Índice

Presentación

ix

Agradecimientos

xi

Introducción

xiii

Extracción y purificación de ADN

1

Laura Patricia Alejos Velázquez, María del Consuelo Aragón Martínez
y Amelia Cornejo Romero

Electroforesis de ADN



27

Francisco Fierro FierroPCR: reacción en cadena de la polimerasa

53

Alejandra Serrato Díaz, Lluvia Flores Rentería, Jaime Aportela Cortez y
Edgar Sierra Palacios

Microsatélites

75

Alejandra Vázquez Lobo Yurén y Ariadna E. Morales García

ADN polimórfico amplificado al azar (RAPD) y regiones
intermedias entre secuencias simples repetidas (ISSR)
Martha Graciela Rocha Munive, Andrea González González
y XitlaliAguirre Dugua

101

AFLP: Polimorfismos en la longitud de los fragmentos
amplificados

127

Alejandra Serrato Díaz y Selene Ramos Ortiz

DGGE: electroforesis en gel con gradiente desnaturalizante

149

María del Rocío Fernández Suárez y Sylvie Le Borgne



PCR en tiempo real

175

Penélope Aguilera, Martha Ruiz Tachiquín, Martha Graciela Rocha Munive,
Benjamín Pineda Olvera y María ElenaChánez Cárdenas

Microarreglos de ADN: fabricación, proceso y análisis

203

Jorge Ramírez Salcedo, Lorena Chávez González,
José Luis Santillán Torres y Simón Guzmán León

Secuenciación de fragmentos de ADN

231

Laura Margarita Márquez Valdelamar , Alejandra Serrato Díaz
y René Cerritos Flores

Glosario

251

Presentación

M

éxico, junto con el resto de América Latina, presenta una altadiversidad de especies de plantas, animales, hongos y bacterias.
Esta riqueza se refleja a nivel de ADN: cada especie mantiene gran

cantidad de genes y alelos. El ADN no sólo contiene la información para construir proteínas, sino que constituye un riquísimo archivo de información que
nos permite reconstruir la historia evolutiva de los grupos y las relaciones
entre los organismos, es decir, nos da lamejor herramienta posible para entender su evolución y su sistemática. Estos genes han sido modelados durante millones de años por la selección natural y otras fuerzas evolutivas,
y representan un importante acervo con infinidad de posibles aplicaciones
biotecnológicas, que representan una serie de proteínas, enzimas y procesos adaptados para las condiciones climáticas y biológicas de nuestropaís.
A pesar de ser una riquísima mina de información y de posibles aplicaciones
tecnológicas e industriales, podremos tener acceso a ella en la medida en que
conozcamos mejor al ADN .
Acceder a la “veta madre” que representa el ADN no es trivial, su sola purificación puede ser muy difícil, especialmente en muchos de los organismos
de nuestras floras, ricos en compuestos secundarios. Una vez quetenemos
el ADN, tenemos todo un abanico de métodos para analizarlo, con diferentes
grados de resolución, costos, ventajas y desventajas ¿cómo decidir cual usar?
¿Cuál será la técnica adecuada para el problema que queremos analizar? Estas
ix

no son preguntas sencillas de responder, y muchas veces nos hemos visto limitados por los métodos disponibles en la actualidad.
En esta obra se presentan, de...