El Genoma
Páginas: 70 (17467 palabras)
Publicado: 24 de octubre de 2012
4
El contenido del genoma
ÍNDICE
4.1 4.2 4.3 4.4 4.5 4.6 4.7 Introducción Los genomas se pueden mapear en diversos niveles de resolución Los genomas individuales muestran gran variación Los RFLP y los SNP pueden utilizarse para el mapeo genético ¿Por qué algunos genomas son tan grandes? Los genomas eucariontes contienen tanto secuencias de DNA repetitivo como no repetitivo Se puedenidentificar genes eucariontes que codifican proteínas por la conservación de exones 4.8 4.9 4.10
Microfotografía electrónica de barrido (MEB) de los cromosomas X e Y en metafase (35.000×). La mayoría del contenido del genoma se encuentra en el DNA cromosómico, aunque algunos orgánulos contienen sus propios genomas. © Biophoto Associates/Photo Researchers, Inc.
4.11 4.12 4.13
La conservación de laorganización del genoma contribuye a identificar genes Algunos orgánulos tienen DNA Los genomas de los orgánulos son DNA circulares que codifican las proteínas de los orgánulos El genoma de cloroplasto codifica para muchas proteínas y para RNA Los cloroplastos y las mitocondrias evolucionaron por endosimbiosis Resumen
72
CAPÍTULO 4
El contenido del genoma
4.1
Introduccióngenoma Grupo completo de secuencias en el material genético de un organismo. Incluye la secuencia de cada cromosoma más cualquier DNA presente en los orgánulos. transcriptoma Conjunto completo de los RNA presente en una célula, tejido u organismo. Su complejidad se debe principalmente al mRNA, pero también incluye RNA no codificantes. proteoma Grupo completo de proteínas que se expresan en el genoma. Aveces, el término se utiliza para describir el grupo de proteínas expresadas por una célula en un momento dado.
interactoma Grupo completo de complejos proteicos o de interacciones entre proteínas presentes en una célula, tejido u organismo.
Una pregunta clave acerca del genoma es cuántos genes contiene. Sin embargo, una pregunta más que fundamental es “¿qué es un gen?”. Claramente, losgenes no se definen solamente como una secuencia de DNA que codifica un polipéptido, debido a que son muchos los genes que codifican múltiples polipéptidos, y a que muchos genes codifican RNA que sirven para otras funciones. Dadas la variedad de funciones del RNA y las complejidades de su expresión, parece prudente enfocarse en el concepto de gen como una “unidad de transcripción”. Sin embargo,grandes zonas de los cromosomas, que anteriormente se creía que carecían de genes, ahora parecen ser transcriptas ampliamente; por lo tanto, en la actualidad, es difícil definir a un “gen” con precisión. Se puede intentar caracterizar tanto la cantidad total de genes como el número de genes que codifican proteínas en cuatro niveles, que corresponden a las etapas sucesivas de la expresión génica: • Elgenoma es el grupo completo de genes de un organismo. En última instancia, se define por la secuencia de DNA completa, aunque de manera práctica no es posible identificar cada gen de manera inequívoca solamente sobre la base de la secuencia. • El transcriptoma es el grupo completo de genes expresados bajo condiciones particulares. Se define en términos del grupo de moléculas de RNA que estánpresentes y pueden referirse a un tipo celular único, o a cualquier organización compleja de células, hasta constituir un organismo. Debido a que algunos genes generan múltiples mRNA, es probable que el transcriptoma sea más grande que el número de genes definidos directamente en el genoma. El transcriptoma incluye los RNA no codificantes (como tRNA, rRNA, y microRNA o miRNA, que se describen en laSección 13.8, Los eucariontes contienen RNA reguladores) así como también mRNA. • El proteoma es el grupo de polipéptidos codificados por el genoma entero o producidos en cualquier célula o tejido particular. Se corresponde con los mRNA en el transcriptoma, aunque existen diferencias de detalles que reflejan cambios en la abundancia relativa o en las estabilidades de los mRNA y de las proteínas....
El contenido del genoma
ÍNDICE
4.1 4.2 4.3 4.4 4.5 4.6 4.7 Introducción Los genomas se pueden mapear en diversos niveles de resolución Los genomas individuales muestran gran variación Los RFLP y los SNP pueden utilizarse para el mapeo genético ¿Por qué algunos genomas son tan grandes? Los genomas eucariontes contienen tanto secuencias de DNA repetitivo como no repetitivo Se puedenidentificar genes eucariontes que codifican proteínas por la conservación de exones 4.8 4.9 4.10
Microfotografía electrónica de barrido (MEB) de los cromosomas X e Y en metafase (35.000×). La mayoría del contenido del genoma se encuentra en el DNA cromosómico, aunque algunos orgánulos contienen sus propios genomas. © Biophoto Associates/Photo Researchers, Inc.
4.11 4.12 4.13
La conservación de laorganización del genoma contribuye a identificar genes Algunos orgánulos tienen DNA Los genomas de los orgánulos son DNA circulares que codifican las proteínas de los orgánulos El genoma de cloroplasto codifica para muchas proteínas y para RNA Los cloroplastos y las mitocondrias evolucionaron por endosimbiosis Resumen
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CAPÍTULO 4
El contenido del genoma
4.1
Introduccióngenoma Grupo completo de secuencias en el material genético de un organismo. Incluye la secuencia de cada cromosoma más cualquier DNA presente en los orgánulos. transcriptoma Conjunto completo de los RNA presente en una célula, tejido u organismo. Su complejidad se debe principalmente al mRNA, pero también incluye RNA no codificantes. proteoma Grupo completo de proteínas que se expresan en el genoma. Aveces, el término se utiliza para describir el grupo de proteínas expresadas por una célula en un momento dado.
interactoma Grupo completo de complejos proteicos o de interacciones entre proteínas presentes en una célula, tejido u organismo.
Una pregunta clave acerca del genoma es cuántos genes contiene. Sin embargo, una pregunta más que fundamental es “¿qué es un gen?”. Claramente, losgenes no se definen solamente como una secuencia de DNA que codifica un polipéptido, debido a que son muchos los genes que codifican múltiples polipéptidos, y a que muchos genes codifican RNA que sirven para otras funciones. Dadas la variedad de funciones del RNA y las complejidades de su expresión, parece prudente enfocarse en el concepto de gen como una “unidad de transcripción”. Sin embargo,grandes zonas de los cromosomas, que anteriormente se creía que carecían de genes, ahora parecen ser transcriptas ampliamente; por lo tanto, en la actualidad, es difícil definir a un “gen” con precisión. Se puede intentar caracterizar tanto la cantidad total de genes como el número de genes que codifican proteínas en cuatro niveles, que corresponden a las etapas sucesivas de la expresión génica: • Elgenoma es el grupo completo de genes de un organismo. En última instancia, se define por la secuencia de DNA completa, aunque de manera práctica no es posible identificar cada gen de manera inequívoca solamente sobre la base de la secuencia. • El transcriptoma es el grupo completo de genes expresados bajo condiciones particulares. Se define en términos del grupo de moléculas de RNA que estánpresentes y pueden referirse a un tipo celular único, o a cualquier organización compleja de células, hasta constituir un organismo. Debido a que algunos genes generan múltiples mRNA, es probable que el transcriptoma sea más grande que el número de genes definidos directamente en el genoma. El transcriptoma incluye los RNA no codificantes (como tRNA, rRNA, y microRNA o miRNA, que se describen en laSección 13.8, Los eucariontes contienen RNA reguladores) así como también mRNA. • El proteoma es el grupo de polipéptidos codificados por el genoma entero o producidos en cualquier célula o tejido particular. Se corresponde con los mRNA en el transcriptoma, aunque existen diferencias de detalles que reflejan cambios en la abundancia relativa o en las estabilidades de los mRNA y de las proteínas....
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