El Plato Del Debate

EL PLATÓ DEL DEBATE: COMUNIDADES CULTIVABLES NO TIENEN UTILIDAD EN LA ECOLOGÍA MICROBIANA AMBIENTAL CONTEMPORÁNEA
Karl Ritz
Discusión: “Las caracterizaciones de comunidades de escala basadas en microbios cultivables son tan irrepresentativas que ellas no tienen utilidad en la ecología microbiana ambiental contemporánea”.
Fondo Histórico:
Los microbios son, por definición, muy pequeños. Lascélulas microbianas individuales y aislamiento de hifas de hongos son invisibles sin ayuda para el ojo humano, y permanecieron intangibles hasta la invención del microscopio en el siglo XVII. Agregaciones de células microbianas para formar la gran escala y entidades visibles ocurre naturalmente y puede ser espectacularmente manifiesta, por ejemplo como lodos bacteriales, mixomiceto plasmodia, yhongos basidiocarpos. En la historia de la microbiología, había un imperativo no sólo simplemente para visualizar células microbianas, pero para enumerarlas y entender sus formas, fisiología, funciones y relaciones con su entorno. Esto requirió el aislamiento, purificación y multiplicación de células para proveer suficiente biomasa para permitir análisis. Ésto fue convenientemente alcanzadousando técnicas de dispersión y dilución, más comúnmente en medio acuoso, seguido por enriquecimiento modesto sobre medios semisólidos, tanto que ostensiblemente células separadas proliferaban y formaban colonias visibles; la enumeración fue entonces basada en estos así llamados CFUs( Unidades Formadoras de Colonias), en reconocimiento del hecho que eso no fue necesariamente una sola célula que fue laoriginadora. Tales técnicas fueron promovidas por Koch en 1880, quien primero usó cortes superficiales de rodajas de patata como una superficie de enriquecimiento, y entonces adoptó películas de gelatina hidratada, los cuales eran mejor apropiados para la visualización de colonias. Métodos entonces desarrollados los cuales adoptaron otros agentes gelantes, más notablemente agar, y una enormevariedad de suplementos nutricionales para tales medios como se hizo evidente que diferentes organismos crecían más o menos efectivamente sobre una variedad de sustratos. Los medios fueron inventados que eran aparentemente selectivos para grupos restringidos o iguales especies de microbios. Éstas técnicas revolucionaron ambas microbiologías médica y ambiental. En un contexto médico, la habilidadpara aislar los microorganismos que causan enfermedad de una manera selectiva permitió a Koch formular y aplicar sus ejemplares postulado, los cuales condujeron a avances significativos en patología. En la ciencia ambiental, una plétora de microorganismos fue aislada de tierra y agua, los cuales, cuando se caracterizaron, revelaron sus roles y significancia en carbón y ciclos elementales,interacciones bióticas y funciones ecológicas. La diversidad de organismos así encontrados era engañosa, y había una suposición generalmente implícita que éstos eran los jugadores significativos en el ecosistema, no menos porque fueran dóciles para estudiar. Como sea, los pioneros microbiólogos del suelo notaron que había había una persistente discrepancia entre el número de células bacterianas quepueden ser directamente observadas en manchas de suelos diluidos cuando la observaron utilizando el microscopio, y el aparente número de bacterias establecidas por dilución en placas. Esto fue generalmente encontrado que del orden de 1% del número de células bacterianas existentes en suelos eran expresadas en sistemas de cultivo, independientemente de la composición del medio adoptado o asociado conlas condiciones de crecimiento. Éste principal para la realización que, como Russell(1923) notó “El número y variedad de bacterias existentes en el suelo es tan enorme que los métodos de separación en el exterior de todas las diferentes formas y de mostrar sus caracteres y funciones han demostrado ser poco prácticos”. Pero ésto no acortó a los Grandes Aisladores tanto como Beijerinck,...