Electroforesis

Aurum plásmido módulo de purificación Mini 
Como parte de la clonación y secuenciación de la serie el Explorador aisla el ADN plásmido de las bacterias transformadas. Los estudiantes inoculanminipreps transformado con las colonias de bacterias en sus placas de agar. A continuación, aislar el ADN de plásmido mediante un procedimiento en tres pasos, lisis alcalina seguida de cromatografía encolumna mini. La purificación puede realizarse en microcentrífugas o con el distribuidor de vacío Aurum. Una vez que el plásmido de ADN se eluye, los estudiantes tienen que verificar la inserción delproducto de PCR en el vector plásmido con enzimas de restricción de análisis de la digestión, y electroforesis en el gel de agarosa. Enzimas de restricción Bgl II, específicos para la detección delplásmido pJET1.2, se presenta en la ligadura y el módulo de transformación. Los estudiantes también pueden determinar la concentración de ADN plásmido usando espectrofotometría o fluorimetría en un pasoopcional.

Módulo de Secuenciación y Bioinformática
 Como parte de la clonación y secuenciación de la serie el Explorador de secuenciar y analizar su ADN clonado. Los estudiantes combinan el plásmidode ADN que contienen los productos de PCR con cebadores de secuenciación en una placa de 96 pocillos y los envía a un servicio de secuenciación. La parte de la GAPDH, gen a clonar con la clonación ysecuenciación de la serie Explorer, puede variar de 0,6 a más de 2 kb de longitud. Para asegurar una cobertura completa de los genes, se proporcionan cuatro cebadores de secuenciación: una haciaadelante y un cebador inverso específico a cada lado del sitio de clonación pJET1.2 y uno hacia adelante y un cebador inverso homólogas a las diferentes regiones en el centro de la GAPDH gen. Por lo tanto,cuatro secuencias independientes se generarán para cada plásmido, estas secuencias se pueden montar en un contig utilizando el módulo de Bioinformática. Se recomienda que cada equipo de estudiantes...