Electroforesis
Páginas: 5 (1204 palabras)
Publicado: 9 de junio de 2010
Material elaborado por F. Agius, O. Borsani, P.Díaz, S. Gonnet, P. Irisarri, F. Milnitsky y J. Monza. Bioquímica. Facultad de Agronomía.
AMINOACIDOS
Las proteínas de bacterias, hongos, plantas y animales están constituidas a partir de las mismas 20 unidades o monómeros: los á-aminoácidos.
•
Los aminoácidos tienen un grupo amino y un grupo carboxilo unidos al mismo carbono
Losá-aminoácidos, moléculas de tamaño pequeño, se denominan así por tener un grupo amino (-NH2) y un grupo carboxilo (-COOH), un átomo de hidrógeno y un grupo distintivo, el radical (–R), unidos al mismo átomo de carbono: el carbono á. Se denomina carbono á el siguiente al carboxilo.
COOH H2 N- C – H R
Aminoácido
COOH H2 N- C – H H
Glicina
Observe que el – R de la glicina es un H
El carbono á semuestra en verde, - R (en rojo) representa al radical que es diferente para cada aminoácido. En todos los aminoácidos excepto la glicina, el átomo de carbono á tiene cuatro grupos sustituyentes diferentes; es un centro quiral.
El –R de los veinte aminoácidos puede diferenciarse en: tamaño, forma, carga, capacidad de formar puentes de hidrógeno o por su reactividad química. Para su denominaciónse usan las tres primeras letras de su nombre común, por ejemplo glicina, Gli, etc. No todos los aminoácidos pueden ser sintetizados por los animales y por eso deben ser ingeridos con la dieta. Esos aminoácidos que no se pueden sintetizar, se conocen como esenciales y son distintos según la especie, la edad y el estado fisiológico.
•
Los aminoácidos pueden agruparse de acuerdo a lapolaridad del – R
Según la característica del radical, los aminoácidos se pueden agrupar en apolares, polares sin carga, polares con carga positiva y polares con carga negativa. Los aminoácidos apolares componen un grupo que se caracterizan porque su –R es una cadena alifática. Debido la naturaleza alifática del –R, no se generan zonas electronegativas o electropositivas en esa región de la molécula ycuando forman parte de proteínas tienden a alejarse del medio acuoso e interaccionar entre sí en zonas internas de la molécula.
Material elaborado por F. Agius, O. Borsani, P.Díaz, S. Gonnet, P. Irisarri, F. Milnitsky y J. Monza. Bioquímica. Facultad de Agronomía.
Aminoácidos apolares
Los aminoácidos con –R polar son aquellos que tienen posibilidades de tener asimetría en la distribuciónde las cargas, por la presencia de un átomo de O, N o S. Como consecuencia, el -R presenta regiones polares que permiten que se formen puentes de hidrógeno con otros – R polares.
Aminoácidos polares sin carga
Material elaborado por F. Agius, O. Borsani, P.Díaz, S. Gonnet, P. Irisarri, F. Milnitsky y J. Monza. Bioquímica. Facultad de Agronomía.
Por otro lado, hay aminoácidos que tienen –R con carga por la presencia de un grupo adicional ácido o base en la molécula. Los aminoácidos ácidos, (aspartato y el glutamato) tienen grupos - R cargados negativamente a pH 7.0 por la presencia del grupo -COOH en el radical. A su vez los aminoácidos básicos, que contienen uno o más –NH2 en el radical, tienen - R cargados positivamente a pH 7.0.
Aminoácidos con carga negativa Aminoácidoscon carga positiva
De las distintas propiedades de los – R, la polaridad o la apolaridad de los mismos, o sea la tendencia a interactuar o no con el medio acuoso, es una característica clave para el ordenamiento en el espacio de las proteínas.
RECUERDE que los ácidos son compuestos que en solución liberan H . Los ácidos presentes en el medio celular sólo se disocian parcialmente, son ácidosdébiles. La reacción general es: -C=O OH
+
+
-C=O O
-
+
H
+
Las bases son sustancias que captan H y en las células se encuentran parcialmente disociadas porque son bases débiles. Un ejemplo son los compuestos que presentan un grupo amino (-NH2), que + tiene tendencia débil a aceptar reversiblemente un H del agua: - NH2 + H
+
- NH3
+
Material elaborado por F. Agius,...
AMINOACIDOS
Las proteínas de bacterias, hongos, plantas y animales están constituidas a partir de las mismas 20 unidades o monómeros: los á-aminoácidos.
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Los aminoácidos tienen un grupo amino y un grupo carboxilo unidos al mismo carbono
Losá-aminoácidos, moléculas de tamaño pequeño, se denominan así por tener un grupo amino (-NH2) y un grupo carboxilo (-COOH), un átomo de hidrógeno y un grupo distintivo, el radical (–R), unidos al mismo átomo de carbono: el carbono á. Se denomina carbono á el siguiente al carboxilo.
COOH H2 N- C – H R
Aminoácido
COOH H2 N- C – H H
Glicina
Observe que el – R de la glicina es un H
El carbono á semuestra en verde, - R (en rojo) representa al radical que es diferente para cada aminoácido. En todos los aminoácidos excepto la glicina, el átomo de carbono á tiene cuatro grupos sustituyentes diferentes; es un centro quiral.
El –R de los veinte aminoácidos puede diferenciarse en: tamaño, forma, carga, capacidad de formar puentes de hidrógeno o por su reactividad química. Para su denominaciónse usan las tres primeras letras de su nombre común, por ejemplo glicina, Gli, etc. No todos los aminoácidos pueden ser sintetizados por los animales y por eso deben ser ingeridos con la dieta. Esos aminoácidos que no se pueden sintetizar, se conocen como esenciales y son distintos según la especie, la edad y el estado fisiológico.
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Los aminoácidos pueden agruparse de acuerdo a lapolaridad del – R
Según la característica del radical, los aminoácidos se pueden agrupar en apolares, polares sin carga, polares con carga positiva y polares con carga negativa. Los aminoácidos apolares componen un grupo que se caracterizan porque su –R es una cadena alifática. Debido la naturaleza alifática del –R, no se generan zonas electronegativas o electropositivas en esa región de la molécula ycuando forman parte de proteínas tienden a alejarse del medio acuoso e interaccionar entre sí en zonas internas de la molécula.
Material elaborado por F. Agius, O. Borsani, P.Díaz, S. Gonnet, P. Irisarri, F. Milnitsky y J. Monza. Bioquímica. Facultad de Agronomía.
Aminoácidos apolares
Los aminoácidos con –R polar son aquellos que tienen posibilidades de tener asimetría en la distribuciónde las cargas, por la presencia de un átomo de O, N o S. Como consecuencia, el -R presenta regiones polares que permiten que se formen puentes de hidrógeno con otros – R polares.
Aminoácidos polares sin carga
Material elaborado por F. Agius, O. Borsani, P.Díaz, S. Gonnet, P. Irisarri, F. Milnitsky y J. Monza. Bioquímica. Facultad de Agronomía.
Por otro lado, hay aminoácidos que tienen –R con carga por la presencia de un grupo adicional ácido o base en la molécula. Los aminoácidos ácidos, (aspartato y el glutamato) tienen grupos - R cargados negativamente a pH 7.0 por la presencia del grupo -COOH en el radical. A su vez los aminoácidos básicos, que contienen uno o más –NH2 en el radical, tienen - R cargados positivamente a pH 7.0.
Aminoácidos con carga negativa Aminoácidoscon carga positiva
De las distintas propiedades de los – R, la polaridad o la apolaridad de los mismos, o sea la tendencia a interactuar o no con el medio acuoso, es una característica clave para el ordenamiento en el espacio de las proteínas.
RECUERDE que los ácidos son compuestos que en solución liberan H . Los ácidos presentes en el medio celular sólo se disocian parcialmente, son ácidosdébiles. La reacción general es: -C=O OH
+
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-C=O O
-
+
H
+
Las bases son sustancias que captan H y en las células se encuentran parcialmente disociadas porque son bases débiles. Un ejemplo son los compuestos que presentan un grupo amino (-NH2), que + tiene tendencia débil a aceptar reversiblemente un H del agua: - NH2 + H
+
- NH3
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Material elaborado por F. Agius,...
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