Empalme de rna
DESARROLLO DEL TEMA EMPALME DE INTRONES
“LA QUIMICA DEL EMPLAME DEL RNA”
BIOLOGIA MOLECULAR
DOCTOR: RAFAEL GUTIERREZ CAMPOS.
Edgar Jesús Tavares Rodríguez 2ºB
Aguascalientes ags, a 14 de MARZO de 2011
SECUENCIAS DENTRO DEL RNA DETERMINAN DONDE SE PRODUCE EL EMPALME.
Los limites entre los entrones y exones están marcados porsecuencias de nucleótidos específicos dentro del mRNA, son estas secuencias las que delinearan donde se producirá el empalme. El limite exón intron es decir el límite del extremo 5” del intron esta marcada por una serie denominada sitio de empalme 5”. El limite del intron-exón en el extremo 3” del intron esta marcado por el sitio de empalme 3” también llamados sitios donante y receptor.
EL INTRON SEELIMINA EN UNA FORMA LLAMADA LAZO CONFORME LO EXONES FLAQUEANTES SE UNEN ENTRE SI.
La química del empalme se logra por dos reacciones de tranesterificacion sucesivas en las que se rompen enlaces fosfodiester dentro del pre RNAm y se forman otros nuevos, el OH del 2 “ desencadena la primera reacción actuando como nuecleofilo para atacar el grupo fosforilo de la guanina, como consecuencia elenlace fosfodiester entre la pentosa y el fosfato en la unión entre el intron y el exón se rompe y el extremo 5” del intron liberándose une a la A en el sitio de ramificación asi además de los enlaces 5” y 3” de la columna de nucleótidos, un tercer enlace fosfodiester.
En la segunda reacción del exón 5” (el OH 3” liberado del exón 5”) invierte su papel y se convierte en un nuecleofilo queataca al grupo fosforilo en el sitio de empalme 3” esta reacción tiene dos consecuencias:
1. Y mas importante une los exones 3” y 5” por ende este es el paso en el que las dos secuencias codificadoras se empalman entre si.
2. Esta misma reacción libera el intron que actúa como grupo saliente a causa de que el extremo 5” se unió a la A. (el intron que se acaba de eliminar tieneforma de lazo).
Una molécula individual de RNAm se divide en 2 molecuals (una de RNAm y el lazo liberado, posteriormente el lazo liberado se degrada rápidamente luego de la remoción y en consecuencia no esta disponible en la reacción inversa.
LOS EXONES DE MOLECULAS DE RNA DIFERENTES SE PUEDEN FUSIONAR POR EMPALME TRANS.
En el empalme alternativo los exones pueden saltearse y unexón dado puede unirse a otro mas corriente abajo, en algunos casos dos exones que están en moléculas de RNAm diferentes pueden empalmarse una con otra mediante el enlace trans el cual no es muy frecuente.
LA MAQUINARIADEL AYUSTOSOMA
“EL EMPALME DEL RNA ACARGO DE UN COMPLEJO GRANDE”
Las reacciones de tranesterificacion esta mediado por una, maquina molecular enorme llamada ayustosomaeste complejo comprende alrededor de 150 proteínas y 5 RNA y su tamaño es semejante al de un ribosoma, para realizar incluso una sola reacción de empalme el ayustosoma hidroliza varias moléculas de ATP, de esta manera los RNA localizan los elementos de la secuencia en los limites del intron - exón y es probable que participen en la reacción de empalme en si.
Los 5 RNAs (U1, U2, U4, U5,U6) reciben la denominación colectiva de snorps RNA pequeños cada uno tiene de entre 100 y 300 nucleótidos, estas cadenas aunadas a las proteínas del complejo de gran tamaño constituye el ayustosoma.
snRNA | Tamaño | Función Respectiva |
U1 | 165 | Corte y empalme reconoce el extremo 5” del intron. |
U2 | 188 | Corte y empalme se une al centro de ramificación lo acercaa 5” |
U3 | 210 | Procesamiento del pre-rRNA |
U4 | 142 | Corte y empalme Se asocia inicialmente con u5 y u6 |
U5 | 116 | Corte y empalme Se asocia inicialmente con u4 y u6 une ambos extremos del intron |
U6 | 107 | Corte y empalme Se asocia inicialmente con u4 y u5 participa en la catálisis |
U7 | 65 | Procesamiento del extremo 3” de los pre-RNAs de...
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