Endonucleasas De Restricción
M.C. Eduardo Franco Frías Lic. Biotecnología Genómica Grupo 452 José Carlos Benítez Hernández Annette del Carmen Flores Cruz Alejandra Marmolejo Garza Norma Estefania Ramírez Ávila Adriana Estefanía Rodríguez Pérez
Grupo de organismos eucariotas que no pueden clasificarse como animales, plantas ni hongos.Características
Eucariotas Heterótrofos/Autótrofos Multicelulares/Unicelulares Sexuales/Asexuales
Clasificación asignada por la International Society of Protistologists
Status Secuenciación
100%
4
90% 80%
12
0 1
11
5
1
1
1
2
0 1
0 1
3
3
2
70% 2
60% 50% 1 40% 4 30% 20% 10% 3 0% 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 3 16 7
2
Procesad
9
Ensambl
CompletoTamaño Genomas
250
200
150 Mb
100 Tamaño Genomas 50 0
Genes
9000 8000
7000 6000 Numero Genes 5000 4000 3000 2000 1000
Genes
0
Kinetoplastids Alveolata Cyanidophytes
GC
60 50
40 %
30 20 10 0 GC
Organismo
Tamaño Genoma
# Cromosom as
Status
Fecha
Pseudoge nes
%GC
Genes
Leishmania braziliensis
Leishmania infantum Leishmania major++Trypanoso ma brucei
62.91 Mb
64.05 Mb
71
72
Complet o
Complet e Complet e Complet e
03/24/20 07
03/24/20 07 03/17/19 99 08/09/20 03
7
2
54
63
8,094
8,980
65.37 Mb
71
1
63
9870
37.798 MB
11
177
46
5272
Trypanoso ma congolense
Trypanoso ma cruzi Trypanoso ma vivax
-
-
Ensambl aje
Ensambl aje Esambla je
08/12/20 11
20052011 08/11/2011
--
--
--
46-89 Mb -
-
3586 --
51 --
25183 --
Trypanosoma brucei
Tamaño del genoma: 37.798 Mb # de cromosomas: 11 %GC: 5272 Pseudogenes: 177 Genes: 8, 980 Status: completo
Protista parásito; causa la tripanosomiasis africana (enfermedad del sueño) en humanos y animales en África. Vector: insecto (la mosca tse‐tse) Huésped: mamífero. La célula experimenta cambioscomplejos para facilitar su supervivencia en el intestino de los insectos y en la sangre de los mamíferos. Cuenta con una cubierta de glicoproteína variante de superficie (VSG) para evitar al sistema inmunitario del huésped.
Organismos modelo para estudiar la variación antigénica, intercambio genético...
Leishmania infantum
Tamaño del genoma: 64.05 Mb # de cromosomas: 72 %GC: 63 Pseudogenes:2 Genes: 8, 980 Status: completo
Parásito intracelular; causa la leishmaniasis canina y felina; leishmaniasis cutánea y visceral en los seres humanos. Vector: insecto (Phlebotomus pappatasi) Huésped: mamífero. Se encuentra comúnmente en América Latina, Asia, África y la región del Mediterráneo. Infecta macrófagos y células dendríticas donde se transforma rápidamente, rompe la célula huésped yasí invade más células fagocíticas.
• Completos 4, Ensamblaje 16, En Proceso 12
Organismo Tamaño # Genoma Cromosom Mb as
23.27 Mb 14
Status
Fecha
Pseud %GC ogene s
107 19
genes
Plasmodium falciparum Cryptosporidium parvum Plasmodium knowlesi Toxoplasma gondii Ascogregarina taiwanensis
Completo
2002
5509
9
8
Completo
2003
none
30
3887
23.462214
Completo
2008
7
37
5161
0.034
11
Completo
2005
none
21
63
6.2
-
Ensamblaje
2010
-
-
-
Plasmodium knowlesi
Tamaño del genoma: 23.4622 Mb # de cromosomas: 22 %GC: 37 Pseudogenes: 7 Genes: 5161 Status: completo
Parásito causante de la malaria en primates, comúnmente presente en el sudeste asiático. Causa la malaria en macacos decola larga (Macaca fascicularis), pero también puede infectar a humanos, ya sea natural o artificialmente. Se utiliza como modelo para el desarrollo de vacunas y drogas de la malaria.
Cryptosporidium parvum
Tamaño del genoma: 9 Mb # de cromosomas: 8 %GC: 30 Pseudogenes: Genes: 3887 Status: completo
Parásito intracelular obligado y tiene un ciclo de vida complejo, desarrollo sexual y...
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