Ensamblaje Del Complejo De Iniciación De La Transcripción.Docx Subida Exitosa
Páginas: 13 (3043 palabras)
Publicado: 8 de julio de 2012
ENSAMBLAJE DEL COMPLEJO DE INICIACIÓN DE LA TRANSCRIPCIÓN
El producto inicial de la transcripción del genoma es el transcriptoma, el conjunto de moléculas de RNA derivadas de los genes que codifican proteínas, cuya información biológica es requerida por la célula en un momento particular. El transcriptoma es mantenido por el proceso denominado transcripción, mediante el cual cada gen escopiado en moléculas de RNA.
Las participantes centrales de la transcripción son las proteínas de unión al DNA, que se unen al genoma para cumplir sus funciones bioquímicas. Las histonas son ejemplos de esas proteínas.
Proteínas de unión al DNA y sus sitios de unión
Para unirse de manera específica una proteína debe entrar en contacto con la doble hélice de modo que pueda reconocer la secuencianucleotídica, lo que exige que parte de la proteína penetre en el surco mayor o menor de la hélice para lograr una lectura directa de la secuencia.
Características especiales de las proteínas de unión al DNA
Cada uno de los motivos de unión al DNA está presente en una serie de proteínas.
* Motivo hélice-giro-hélice está presente en las proteínas procariontes y eucariontes.
El motivo estáformado por dos hélices α separadas por un giro, denominado giro β.
La segunda hélice α es la hélice de reconocimiento que establece los contactos vitales que permiten leer la secuencia de DNA.
Otras versiones del motivo HTH hallado en los eucariontes son:
El dominio POU. Que se suele hallar en proteínas que también tienen un homeodominio.
El motivo hélice-giro-hélice alada. Presenta una tercerahélice α a un lado del motivo HTH y una hoja β del otro lado.
Otros motivos que se unen a ácidos nucleicos.
* El dominio básico. En el que la estructura de reconocimiento del DNA es una hélice α que contiene un alto número de aminoácidos básicos.
* El motivo cinta-hélice-hélice. Es uno de los pocos motivos que logra unión al DNA específica de secuencia sin usar una hélice α comoestructura de reconocimiento.
* El dominio TBP. Sólo se ha descubierto en la proteína de unión a TATA.
* El dominio de ribonucleoproteína (RNP). Comprende cuatro cadenas β y dos hélices α en el orden β-α-β-β-α-β.
* El dominio de unión al RNA de doble cadena (dsRBD). Es similar al dominio RNP, pero tiene la estructura α-β-β-α.
* El dominio de homología κ. Tiene la estructura β-α-α-β-β-α, yla función de unión está entre el par de hélices α.
Localización de las posiciones de los sitios de unión al DNA en un genoma
La secuencia de un gen recién descubierto, se supone que contiene tanto DNA codificante como regiones corriente arriba de este, permite acceso inmediato a los sitios de unión de por lo menos algunas de las proteínas responsables de su expresión. Se han ideado variosmétodos para localizar los sitios de unión a las proteínas dentro de fragmentos de DNA de hasta varias kilobases de longitud.
La técnica de retardo en gel identifica fragmentos de DNA que se unen a proteínas. Aprovecha la diferencia sustancial entre las propiedades electroforéticas del fragmento de DNA “desnudo” y el que está unido a una proteína.
Los análisis de protección señalan los sitios deunión con mayor exactitud. El análisis de retardo en gel aporta una indicación general de la localización de un sitio de unión a la proteína en una secuencia de DNA, pero no especifica el sitio con exactitud.
La modificación de interferencia identifica nucleótidos centrales para la unión a las proteínas. Trabaja sobre la base de que si se altera un nucleótido crucial para la unión a las proteínasse puede impedir la unión.
Interacción entre el DNA y sus proteínas de unión
En la actualidad se reconoce que la secuencia nucleotídica también incide en la conformación precisa de cada región de la hélice, en la que la secuencia de DNA puede influir en la unión a las proteínas.
Lectura directa de la secuencia de nucleótidos. Era evidente que aunque las bases nucleotídicas se encuentran...
El producto inicial de la transcripción del genoma es el transcriptoma, el conjunto de moléculas de RNA derivadas de los genes que codifican proteínas, cuya información biológica es requerida por la célula en un momento particular. El transcriptoma es mantenido por el proceso denominado transcripción, mediante el cual cada gen escopiado en moléculas de RNA.
Las participantes centrales de la transcripción son las proteínas de unión al DNA, que se unen al genoma para cumplir sus funciones bioquímicas. Las histonas son ejemplos de esas proteínas.
Proteínas de unión al DNA y sus sitios de unión
Para unirse de manera específica una proteína debe entrar en contacto con la doble hélice de modo que pueda reconocer la secuencianucleotídica, lo que exige que parte de la proteína penetre en el surco mayor o menor de la hélice para lograr una lectura directa de la secuencia.
Características especiales de las proteínas de unión al DNA
Cada uno de los motivos de unión al DNA está presente en una serie de proteínas.
* Motivo hélice-giro-hélice está presente en las proteínas procariontes y eucariontes.
El motivo estáformado por dos hélices α separadas por un giro, denominado giro β.
La segunda hélice α es la hélice de reconocimiento que establece los contactos vitales que permiten leer la secuencia de DNA.
Otras versiones del motivo HTH hallado en los eucariontes son:
El dominio POU. Que se suele hallar en proteínas que también tienen un homeodominio.
El motivo hélice-giro-hélice alada. Presenta una tercerahélice α a un lado del motivo HTH y una hoja β del otro lado.
Otros motivos que se unen a ácidos nucleicos.
* El dominio básico. En el que la estructura de reconocimiento del DNA es una hélice α que contiene un alto número de aminoácidos básicos.
* El motivo cinta-hélice-hélice. Es uno de los pocos motivos que logra unión al DNA específica de secuencia sin usar una hélice α comoestructura de reconocimiento.
* El dominio TBP. Sólo se ha descubierto en la proteína de unión a TATA.
* El dominio de ribonucleoproteína (RNP). Comprende cuatro cadenas β y dos hélices α en el orden β-α-β-β-α-β.
* El dominio de unión al RNA de doble cadena (dsRBD). Es similar al dominio RNP, pero tiene la estructura α-β-β-α.
* El dominio de homología κ. Tiene la estructura β-α-α-β-β-α, yla función de unión está entre el par de hélices α.
Localización de las posiciones de los sitios de unión al DNA en un genoma
La secuencia de un gen recién descubierto, se supone que contiene tanto DNA codificante como regiones corriente arriba de este, permite acceso inmediato a los sitios de unión de por lo menos algunas de las proteínas responsables de su expresión. Se han ideado variosmétodos para localizar los sitios de unión a las proteínas dentro de fragmentos de DNA de hasta varias kilobases de longitud.
La técnica de retardo en gel identifica fragmentos de DNA que se unen a proteínas. Aprovecha la diferencia sustancial entre las propiedades electroforéticas del fragmento de DNA “desnudo” y el que está unido a una proteína.
Los análisis de protección señalan los sitios deunión con mayor exactitud. El análisis de retardo en gel aporta una indicación general de la localización de un sitio de unión a la proteína en una secuencia de DNA, pero no especifica el sitio con exactitud.
La modificación de interferencia identifica nucleótidos centrales para la unión a las proteínas. Trabaja sobre la base de que si se altera un nucleótido crucial para la unión a las proteínasse puede impedir la unión.
Interacción entre el DNA y sus proteínas de unión
En la actualidad se reconoce que la secuencia nucleotídica también incide en la conformación precisa de cada región de la hélice, en la que la secuencia de DNA puede influir en la unión a las proteínas.
Lectura directa de la secuencia de nucleótidos. Era evidente que aunque las bases nucleotídicas se encuentran...
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