Estudiante

 Diego Leyva Castañeda a 20 de febrero de 2013

“Interpretando el Árbol Universal Filogenético”
El árbol filogenético universal no sólo se extiende por toda la vida existente, pero sus raíces y ramificaciones representan las etapas más tempranas del proceso evolutivo antes de los modernos tipos decélulas. En consecuencia, la transferencia horizontal de genes desde el principio se ha generalizado, ha dominando la dinámica evolutiva. La raíz del árbol filogenético universal, representa la primera etapa en la evolución celular, cuando la célula en evolución se convirtió en lo suficientemente integrada y estable a los efectos erosivos de transferencia horizontal de genes originando loslinajes más actuales.
El Gran Reto
Un siglo pasaría, sin embargo, antes de que la visión de Darwin se convirtió en realidad. Darwin sabía que las metodologías de la jornada, la paleontología y la clásica taxonomía, no estaban a una tarea tan monumental. Como se previo, la Biología se trasladó a un base molecular en el siglo siguiente, la evolución dejaría de ser un foco, y lo que Darwin considera unproblema básico efectivamente desaparece de la vista. Sin embargo, una visión de esta idea central, es esencialmente biológica, no puede permanecer para siempre oscurecida. En la 1960, con el advenimiento de la secuenciación molecular, historias de genes y genealogías surgió en el escenario molecular; y con la reciente erupción de la secuenciación genómica, la plena historia de la vida celular eneste planeta ahora parece estar desarrollándose ante nuestros ojos.
La diferencia más importante entre el nuevo concepto molecular fue el de aproximarse a las relaciones evolutivas, cuyos fenotipos son invariantes en el grupo, ahora podría utilizarse para inferir las relaciones filogenéticas dentro del grupo. Por lo tanto, mediante la comparación de las secuencias de las moléculas cuyasfunciones son universales, fue posible no sólo para construir árboles genealógicos para los grandes reinos de Darwin, sino también para ir más allá y construir un árbol filogenético universal, que unía toda la reinos en un solo imperio filogenetico. ARN ribosomal fue central en este esfuerzo
El impacto inicial más fuerte para el árbol universal ha sido en microbiología. Por primera vez, la microbiologíaasienta dentro de un marco filogenético y por lo tanto se está convirtiendo en una completa disciplina biológica: el estudio de la diversidad microbiana se ha movido a partir de una colección de viñetas aisladas para un estudio significativo en relaciones.
Una nueva era, una nueva perspectiva
En la década de 1990, la biología entró en la era genómica. Ahora que las secuencias de las muchasmoléculas, cuyas distribuciones son filogenéticamente amplias y no universal, son conocidas, los biólogos encuentran que árboles filogenéticos universales pueden inferirse de muchos de ellos y no lo hacen fundamentalmente de acuerdo con el rRNA. La causa de esta incongruencia es, por supuesto, la evolución reticular, el flujo horizontal de genes. Las reacciones iniciales a la confusión de los árboleshan sido a lo largo de varias líneas. Una es que el árbol de rRNA no es el árbol verdadero de los organismos. Otra reacción es que el dominio archaea y eubacteria se relacionan específicamente porque tienen más genes (principalmente metabólicos) en común con los demás que con los eucariotas. Esta afirmación se basa en numerología, no en análisis filogenéticos. Una tercera reacción se da en latransferencia horizontal de genes por haber borrado por completo cualquier registro de las más profundas ramificaciones en el árbol filogenético universal, la raíz y las primeras ramificaciones del árbol no son cognoscibles.
Una lección de algunos Errantes. Las sintetasas aminoacil-ARNt, quizá mejor que cualquier otra molécula en la célula, ejemplifican la situación actual y ayuda a entenderlo....