Evo1415

[ANÁLISIS
 FILOGENÉTICO
 –
 EVOLUCIÓN
 14/15]
  1
 

 

PRÁCTICA
 ANÁLISIS
 FILOGENÉTICO
 
EVOLUCIÓN
 2014/2015
 
 (1º
 CURSO
 GRADO
 BIOLOGÍA)
 

 


 


 

PROGRAMA
 PREVISTO
 
15:00
 –
 16:10
 
16:10
 –
 16:40
 
16:40
 –
 17:10
 
17:10
 –
 18:00
 

 

 

Actividad
 1:
 Recolección
 de
 datos
 y
 cálculo
 de la
 longitud
 de
 un
 árbol
 
 
Actividad
 2:
 Reconstrucción
 ancestral
 de
 caracteres
 
Descanso
 
Actividad
 3:
 Búsqueda
 del
 árbol
 de
 máxima
 parsimonia
 
 

Actividad
  1:
  Recolección
  de
  datos
  y
  cálculo
  de
  la
  longitud
  de
  un
  árbol
 
(manual)
 
1.1.
 Construcción
 de
 una
 matriz
 de datos
 
1.2.
 Cálculo
 visual
 de
 la
 longitud
 de
 un
 árbol
 

 

Actividad
 2:
 Reconstrucción
 ancestral
 de
 caracteres
 (manual)
 
2.1
 Longitud
 de
 árbol
 con
 el
 algoritmo
 de
 Fitch
 
 
2.2
 Reconstrucción
 ancestral
 más
 parsimoniosa
 

 

Actividad
 3:
 Estimación
 de
 árboles
 con
 Phylip (ordenador)
 
3.1
 Estimación
 del
 árbol
 MP
 con
 Phylip
 
3.2
 Visualización
 de
 árboles
 con
 FigTree
 

 

Actividad
 4:
 Actividad
 no
 presencial
 
4.1
 Reconstrucción
 filogenética
 
4.2
 Evolución
 de
 caracteres
 

 

 

 


 

1
 

2
  [ANÁLISIS
 FILOGENÉTICO
 –
 EVOLUCIÓN
 14/15]
 

 

Actividad
 1:
 Recolección de
 datos
 y
 búsqueda
 del
 árbol
 de
 
máxima
 parsimonia
 (manual)
 

 
En
  esta
  actividad
  vamos
  a
  construir
  una
  matriz
  de
  datos
  con
  varios
  caracteres
  humanos
 
hereditarios
 y
 estimar
 el
 árbol
 de
 máxima
 parsimonia
 para
 cada
 grupo
 de
 4
 estudiantes.
 

 

1.1
 Construcción de
 una
 matriz
 de
 datos
 
El
 primer
 paso
 en
 cualquier
 análisis
 filogenético
 es
 obtener
 una
 matriz
 de
 caracteres
 de
 
los
  taxones
  de
  interés.
  Como
  ya
  se
  ha
  explicado,
  los
  caracteres
  informativos
  para
 
parsimonia
  son
  los
  caracteres
  derivados
  compartidos,
  también
 denominados
 
sinapomorfias.
 

 
EJERCICIO
 1.1.1.
 Contesta
 individualmente
 a
 las
 siguientes
 preguntas
 y
 rellena
 la
 Tabla
 1.
 
Codifica
 las
 respuestas
 de
 la
 siguiente
 manera:
 "si"
 =
 1;
 "no"
 =
 0;
 "no
 lo
 sé"
 =
 ?.
 

 
1. ¿Tienes
 los
 ojos
 marrones?
 
2. ¿Puedes
 enrollar
 tu
 lengua?
 
3.¿Te
 hace
 estornudar
 la
 luz
 del
 sol?
 
4. ¿Tienes
 hoyuelo
 en
 el
 mentón?
 
5. ¿Usas
 gafas
 desde
 antes
 de
 la
 adolescencia?
 
6. ¿Tienes
 el
 pelo
 rizado
 de
 manera
 natural?
 
7. ¿Eres
 zurdo?
 
8. ¿Puedes
 torcer
 el
 pulgar
 hacia
 atrás?
 
9. ¿Al
 aplaudir
 colocas
 el
 pulgar
 izquierdo
 por
 encima del
 derecho?
 
10. ¿Tienes
 pecas?
 

 
Tabla
 1.
 Respuestas
 individuales
 a
 las
 preguntas
 sobre
 caracteres
 humanos
 hereditarios.
 


 

 
Pregunta
 

 
1
 
2
 
3
 
Estudiante
 
 

 

 

4
 

 

5
 

 

6
 

 

7
 

 

8
 

 

9
 

 

10
 

 


 

 

 
EJERCICIO
  1.1.2.
 Junta
 ahora
 los datos
 individuales
 en
 la
 Tabla
 2
 para
 construir
 la
 matriz
 
de
 caracteres.
 

 
Tabla
 2.
 Matriz
 de
 datos
 del
 grupo
 de
 estudiantes.
 

 

 
Pregunta
 
Estudiante
  1
 
2
 
3
 
4
 
5
 
6
 
A
 

 

 

 

 

 

 
B
 

 

 

 

 

 

 
C
 

 

 

 

 

 

 
D
 

 ...