EVOLUCIO N DEL ADN NO CODIFICANTE

LA VARIACIÓN FUNCIONAL Y EVOLUCIÓN DEL ADN NO-CODIFICANTE
Christine P Bird, Barbara E Stranger Y Emmanouil T Dermitzakis
El enfoque de los grandes estudios de genómica se ha desplazado de sólo mirar sucesiones de genes y codificación de proteínas a explorar el conjunto lleno de elementos en cada genoma. La explosión de datos de secuenciación comparativa se ha llevado a un aumento en lasmetodologías, enfoques e ideas sobre cómo analizar la fracción desconocida del genoma, es decir, la fracción no codificadora de proteínas. Los principales asuntos relacionan al descubrimiento, análisis evolutivo y variación natural de no-codificando ADN, y de los parámetros que previenen nosotros de comprender completamente las propiedades de no-codificando ADN.
INTRODUCCIÓN.
En los últimos años, el ADNno codificado ha atraído mucha atención. Esto ha sido principalmente debido a la realización que una fracción grande — a veces la mayoría — de ADN funcional en el genoma humano y de otros no está codificada por secuencias codificadoras de proteínas, sino por otras secuencias, la función exacta de la que sigue siendo difícil de alcanzar. Durante muchos años antes de esta realización, la mayoría delas atenciones y recursos fueron dirigidos hacia el estudio de secuencias codificadoras de proteínas, y es necesario un esfuerzo para convencer a la comunidad que la parte no codificante del genoma de los puertos son interesantes y valiosas joyas.
Una visión histórica de la anotación del genoma nos muestra que durante muchos años la presencia de ARNm y los marcos abiertos de lectura se considerócomo prueba de que una secuencia se génica. Por esta razón, se iniciaron grandes esfuerzos para identificar ADNc y, posteriormente, etiquetas de secuencias expresadas (ESTs).
Tales esfuerzos facilitaron el descubrimiento y la anotación de genes; y metodologías basadas en pruebas para el descubrimiento de genes se han desarrollado. En la última década, los métodos comparativos han sidodesarrollados para explorar la función del genoma más lejos mirando a la conservación de la secuencia, comenzando con el análisis del genoma del ratón.
En esta secuencia de acontecimientos, es comprensible que a las secuencias de genes se les dio prioridad. Pero uno se pregunta cuál es el enfoque si hubiera sido ADNc gran escala y los esfuerzos de secuenciación comparativa había precedido y tecnologíasecológicamente racionales. Podríamos haber llegado a la conclusión de que limitado (es decir, conservado) las secuencias son importantes, independientemente de que sean objeto de la transcripción. Es fácil argumentar que la restricción de la evolución es un indicador mucho más fiable de la funcionalidad que la transcripción es, y el retraso en la no utilización de la codificación del ADN es un ejemplo desesgo de evaluación en nuestras metodologías experimentales.
En este artículo examinamos algunas de las antiguas, pero sobre todo los recientes datos sobre la evolución no codificante del ADN y la función. La explosión de enfoques experimentales y analíticos que se han aplicado a las secuencias de codificación no puede ser plenamente capturado en esta revisión, sino que hemos intentado dar a losaspectos más destacados y para indicar algunas direcciones nuevas y muy interesantes de la investigación. A los efectos de esta revisión, no codificante del ADN se define como las regiones de ADN que no se corresponden con el ADN codificante o no los genes codificantes de ARN (por ejemplo, ARNr y micro ARN), porque el mundo no codificante de genes ARN constituye una categoría grande funcional delas secuencias genómicas que no podemos abordar aquí.
EVOLUCIÓN Y ANÁLISIS COMPARATIVO DE LOS ELEMENTOS NO CODIFICANTES
Desde los primeros días de la secuencia de análisis comparativo, es evidente que hay una gran fracción de ADN no codificante conservado. Algunos estudios preliminares han indicado que gran parte de ella es, probablemente, de reglamentación y que confiar simplemente en la...