EXPLICACI N RESULTADOS NUTRI GENOMICA

Figura 1:
Diagramas de dispersión representativos que muestran los perfiles de metilación de los gemelos con las tres enfermedades autoinmunes estudiadas (SLE, RA, y DM), en comparación con sus respectivos gemelos sanos.
(A) Diagrama de dispersión correspondiente a los datos promedio de cinco parejas de gemelos monocigóticos discordantes para la RA (izquierda) y DM (derecha). (Rojo) Los genescon diferencias significativas en los resultados promediados de cinco parejas de gemelos monocigóticos discordantes para LES: ilustran la ausencia de diferencias, lo que indica que, al menos para los 807 promotores en esta matriz, no se habían producido cambios significativos en el estado de metilación del ADN en estas dos enfermedades.
(B) (Izquierda) Diagrama de dispersión correspondiente a losresultados promediados de cinco parejas de gemelos monocigóticos discordantes para él LES. (Derecha) La comparación de los datos promedio de cinco pares de controles. No fueron emparentados por la raza, la edad y el género con las muestras del panel de la izquierda. (Rojo) genes significativos.
(C) (Izquierda) Una comparación de un solo par de gemelos monocigóticos discordantes para él LES.(Rojo) Los genes con diferencias significativas en los resultados promediados de cinco pares de gemelos monocigóticos.
B y C: Encontramos un conjunto común de genes que muestran la metilación del ADN diferencial en los gemelos con LES en comparación con sus gemelos sanos. (EXPLICACIÓN: 5 pares de gemelos monocigóticos (GMZ) discordantes para RA y DM no tenían diferencias al comparar sus patrones demetilación del DNA, pero los GMZ discordantes para LES si la tenían).
(D) Mapa de calor. Incluye los datos para los 49 genes (54 sondas) que muestran la metilación diferencial entre los afectados con LES y los pares de gemelos monocigóticos saludables. (Se incluyeron cinco muestras). También están incluidos cinco controles adicionales para edad, género y raza sana para cada uno de los cinco paresde gemelos monocigóticos.
Una escala se muestra en la parte inferior, mediante el cual los valores positivos (rojo) y negativos (azul), corresponden respectivamente a un estado superior y un estado de metilación más bajo que el promedio.
Este análisis confirmó la existencia de diferencias de metilación del ADN entre los gemelos MZ (monocigóticos) discordantes para el LES. Adicionalmente, semostró que los niveles de metilación para estos genes en el hermano con LES son comparables a los observados en cada uno de los individuos de pares de gemelos concordantes con LES.
El análisis estadístico de los datos combinados de los cinco gemelos monocigóticos discordantes para él LES mostró que 49 genes tenían diferencias significativas en la metilación del ADN entre él LES y gemelos MZsaludables.
Las comparaciones entre los gemelos monocigóticos, que son genéticamente idénticos, evita los efectos de cualquier posible interferencia que podría causar SNPs (Polimorfismo de un solo nucleótido: es una variación en la secuencia de ADN que afecta a una sola base (adenina (A), timina (T), citosina (C) o guanina (G)) de una secuencia del genoma.) en este tipo de análisis. La especificidad de lasdiferencias observadas se destaca por el hecho de que estos cambios corresponden a la media de cinco pares de gemelos monocigóticos discordantes para él LES, que fueron casi idénticos al patrón obtenido para cada uno de los pares individuales de gemelos MZ.
Es de particular interés que este conjunto de 49 genes, que están metilados diferencialmente en LES y gemelos MZ sanos, no mostró cambiossignificativos de metilación en comparación con los perfiles de metilación del ADN de los cinco pares de controles normales no relacionados emparejados por edad, género, y raza, lo que sugiere que las mencionadas diferencias de metilación de ADN son específicos para los distintos fenotipos de LES y gemelos sanos.




Figura 2:
Una comparación de los niveles de metilación de ADN de ocho genes en...