Extraccion de adn, pcr, electroforesis vertical

Aplicaciones de Genómica en Laboratorios de Producción Animal
Susana Dunner, Javier Cañón
Laboratorio de Genética. Facultad de Veterinaria de la UCM http://www.ucm.es/info/genetvet

Introducción Marcadores genéticos moleculares Tipos de marcadores Aplicaciones Métodos de diagnóstico en sanidad animal Detección de portadores Identificación genética Trazabilidad Control de filiación Detecciónde la introgresión genética: exclusión y asignación Análisis de diversidad genética Selección asistida por marcadores Genómica funcional

INTRODUCCIÓN
Hasta no hace muchos años, las principales técnicas de diagnóstico veterinario, en el campo de sanidad animal, bromatología o producción animal, se basaban en métodos de interacción entre productos más o menos inmediatos del ADN: interacción entreproteínas fundamentalmente. Métodos de diagnóstico de enfermedades infecciosas o parasitarias, detección de portadores de enfermedades hereditarias o controles de filiación para la gestión de libros genealógicos, son ejemplos de esa situación, en las que la reacción antígeno-anticuerpo constituía el elemento central. No queremos decir que esto ya no sea así hoy, sino que actualmente existentécnicas alternativas, cada vez más numerosas, que permiten visualizar la causa primaria. Parece lógico pensar que métodos que se basan en la identificación de fenotipos (básicamente interacción entre proteínas) logren menor especificidad, es decir, mayores errores tipo I (mayor probabilidad de obtener falsos positivos) y menor sensibilidad, es decir, menores potencias de diagnóstico (menor probabilidadde detección de positivos) que métodos que se basan en la detección del ADN causante del fenotipo. El objetivo general de los métodos genómicos consiste en la visualización del ADN diana, el ADN que explica el fenotipo de interés, o simplemente el ADN responsable de genotipos de interés. El interés puede ser, por lo tanto, la detección de una región específica del ADN, por ejemplo, de Leishmaniaque sería la prueba de la existencia de infección, aunque tal vez no del padecimiento de la enfermedad entendida como la presencia de sintomatología clínica, o bien la identificación del genotipo de una oveja que le confiere resistencia al scrapie. La molécula de ADN, tanto si es única como ocurre en determinados microorganismos, como si está fragmentada en cromosomas, tiene un tamañosuficientemente grande como para ser necesario acudir a métodos de criba que permitan la visualización sólo de aquél que resulte de nuestro interés. Los esfuerzos, por lo tanto, desde el punto de vista laboratorial se dirigen fundamentalmente a estrategias de acotamiento o delimitación del ADN que explica el genotipo o fenotipo de interés, y a la visualización de ese ADN. Por supuesto, estamos

dando porhecho que existe un enorme trabajo previo de investigación que ha puesto de manifiesto la singularidad que nos interesa de ese ADN. A diferencia de lo que ha ocurrido en genética vegetal y en genética humana, en producción animal la inversión dedicada a desarrollo genómico ha sido, hasta fechas recientes, mucho más reducida. Sin embargo, las iniciativas llevadas a cabo a propósito de los proyectospara secuenciar el genoma humano han servido de catalizador para cambiar en los últimos 10 años el interés de los grupos de genética animal hacia la genómica. La genómica es una subdisciplina de la genética que tiene por objetivo la caracterización molecular de genomas completos. Surge de la integración de las cinco áreas tradicionales de genética (genética mendeliana, citogenética, genéticamolecular, genética de poblaciones y genética cuantitativa) con nuevas tecnología de informática y robótica. Los principales hitos que se pueden señalar como principales responsables del gran desarrollo actual de la genómica serían los siguientes: a) el descubrimiento en 1970 por Daniel Nathans y Hamilton Smith de las endonucleasas o enzimas de restricción; b) el desarrollo en 1977 de dos métodos de...