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La relación de fuerzas en el plano naval era favorable por completo para el Reino Unido, que contaba con la marina de guerra mejor armada del mundo mientras la flota de guerra francesa tenía unadeficiente organización y una menor potencia en sus barcos. Ciertamente el ejército francés era entonces más numeroso y mejor armado que el británico, pero este factor era de menor importancia en caso delibrar una guerra lejos de Europa, en lugares donde sería indispensable contar con gran apoyo naval.
La superioridad naval británica fue considerada por los políticos franceses como un elementodisuasivo muy importante, lo cual generó que el gobierno francés ordenase a sus tropas la retirada el 3 de noviembre de 1898, dando fin al incidente. Además, el Caso Dreyfus generaba más pasionespolíticas en la prensa de Francia que una lejana pugna contra los británicos en Sudán; junto con ello, diversos políticos franceses como el ministro de asuntos exteriores Théophile Delcassé, habían consideradoque para los intereses de Francia era más conveniente contar con apoyo del Reino Unido en caso de guerra con Alemania, y no deseaban dañar una posible alianza sólo por causa de un remoto rincón deÁfrica donde Francia había llegado demasiado tarde.
Marchand y sus hombres emprendieron el camino de retorno en cuanto recibieron la orden respectiva desde París, llegando a Brazaville a mediados de1899. De inmediato Marchand recibió órdenes de dirigirse con sus oficiales a la Francia metropolitana, llegando a Tolón a fines de junio de 1899 y recibiendo un homenaje nacional en la festividad del 14de julio del mismo año.
Algunos historiadores consideran que la solución de este incidente y el aumento de la influencia de Alemania en la zona fueron los precursores de la firma de la Ententecordiale (1904), en virtud de la cual Francia reconocía el dominio británico en Egipto (la cuenca del Nilo) y un condominio anglo-egipcio sobre el Sudán, a cambio de actuar libremente en Marruecos....