Factor Promotor
Páginas: 8 (1766 palabras)
Publicado: 16 de octubre de 2012
1.-El inicio de la transcripción necesita que el factor σ esté unido al núcleo central de la ARN polimerasa. Existen unas secuencias de ADN específicas y necesarias para que la holoenzima reconozca el lugar de comienzo de la transcripción, dichas secuencias específicas se denominan secuencias promotoras. Pribnow (1975) aisló y secuenció las regiones de ADN que quedaban protegidas por la ARNpolimerasa después de someterlas a digestión con ADNasa pancreática. Siguiendo este método se secuenciaron los primeros promotores de fagos como el T7 y λ, y del promotor del operón lactosa. Pribnow observó una secuencia de unos 7 pares de bases que se encontraba 10 bases antes de la primera que se transcribe y que aparecía en la mayoría de los fragmentos protegidos por la ARN polimerasa. Estasecuencia se la denominó Caja de Pribnow y es: 5' TATPuATPu 3'.
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|Secuencias promotoras consenso de E. coli y eucariontes |Pribnow |
Cuando se analizan las secuencias de las regiones anteriores a laprimera base que se transcribe aparecen dos regiones cortas que muestran un parecido o similitud bastante grande, la primera región se encuentra 10 bases antes de la primera que se transcribe (Caja de Pribnow) y la segunda se localiza 35 bases antes. El estudio de muchas regiones promotoras de diferentes genes permite determinar las secuencias que aparecen con mayor frecuencia y establecer lo quese denomina las secuencias promotoras consenso o ideales.
Los resultados obtenidos en E. coli después de analizar 100 regiones promotoras son los siguientes:
|Secuencias consenso promotoras en E.coli |
|5' ....... T82T84G78A65C54a45 ................ T80A95t45A60a50T96 ...................CAT ..............3' |
|5' ....... -35 ................ -10 ................... 1ª bases |
|transcrita |
|El subíndice indica el porcentaje de aparición de la base más frecuente de esa posición. Si laletra es mayúscula indica que el |
|porcentaje de aparición es mayor del 54% y si es minúscula que es inferior al 54%. |
El factor sigma es el responsable de que la ARN polimerasa reconozca estas secuencias y se una a ellas. La holoenzima recorre el ADN hasta encontrar las regiones -10 y -35 (secuencias promotoras) y se une a ellas,posteriormente comienza a separar las dos hélices por la región -10 (rica en pares AT). Cuando la holoenzima ha reconocido y separado las dos hélices se forma lo que se denomina "complejo abierto con el promotor".
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|Iniciación de la Transcripción|Secuencias de regiones promotoras de E. coli |
La actividad de los promotores puede modificarse por la presencia de otras secuencias estimuladoras o "enhancers" que aumentan la tasa de transcripción o por secuencias atenuadoras que disminuyen la tasa de trasncripción. Estas secuencias estimuladoras y/o atenuadoras suelen estar cerca de laspromotoras pero no a una distancia fija de estas y pueden ejercer su función sobre varios promotores diferentes.
En eucariontes la iniciación de la transcripción es más compleja que la de E. coli y depende de la presencia de Factores proteicos de transcripción (TF). La mayoría de las secuencias promotoras eucarióticas se encuentran antes (o "aguas arriba") de la primera base transcrita, aunque...
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|Secuencias promotoras consenso de E. coli y eucariontes |Pribnow |
Cuando se analizan las secuencias de las regiones anteriores a laprimera base que se transcribe aparecen dos regiones cortas que muestran un parecido o similitud bastante grande, la primera región se encuentra 10 bases antes de la primera que se transcribe (Caja de Pribnow) y la segunda se localiza 35 bases antes. El estudio de muchas regiones promotoras de diferentes genes permite determinar las secuencias que aparecen con mayor frecuencia y establecer lo quese denomina las secuencias promotoras consenso o ideales.
Los resultados obtenidos en E. coli después de analizar 100 regiones promotoras son los siguientes:
|Secuencias consenso promotoras en E.coli |
|5' ....... T82T84G78A65C54a45 ................ T80A95t45A60a50T96 ...................CAT ..............3' |
|5' ....... -35 ................ -10 ................... 1ª bases |
|transcrita |
|El subíndice indica el porcentaje de aparición de la base más frecuente de esa posición. Si laletra es mayúscula indica que el |
|porcentaje de aparición es mayor del 54% y si es minúscula que es inferior al 54%. |
El factor sigma es el responsable de que la ARN polimerasa reconozca estas secuencias y se una a ellas. La holoenzima recorre el ADN hasta encontrar las regiones -10 y -35 (secuencias promotoras) y se une a ellas,posteriormente comienza a separar las dos hélices por la región -10 (rica en pares AT). Cuando la holoenzima ha reconocido y separado las dos hélices se forma lo que se denomina "complejo abierto con el promotor".
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|Iniciación de la Transcripción|Secuencias de regiones promotoras de E. coli |
La actividad de los promotores puede modificarse por la presencia de otras secuencias estimuladoras o "enhancers" que aumentan la tasa de transcripción o por secuencias atenuadoras que disminuyen la tasa de trasncripción. Estas secuencias estimuladoras y/o atenuadoras suelen estar cerca de laspromotoras pero no a una distancia fija de estas y pueden ejercer su función sobre varios promotores diferentes.
En eucariontes la iniciación de la transcripción es más compleja que la de E. coli y depende de la presencia de Factores proteicos de transcripción (TF). La mayoría de las secuencias promotoras eucarióticas se encuentran antes (o "aguas arriba") de la primera base transcrita, aunque...
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