Fern Phylogeny Inferred From 400 Leptos Hellip

Fern phylogeny inferred from 400 leptosporangiate species and three
plastid genes
Eric Schuettpelz & Kathleen M. Pryer
Introduccion.
Una evaluación precisa y robusta de la filogenia es fundamental para la plena comprensión de los orígenes evolutivos, ya que proporciona el patrón general de la divergencia, un histórico marco para explorar tanto la evolución y diversificación. Aunque lareconstrucción de la filogenia sigue siendo una tarea difícil, el uso de datos de secuencias de ADN ha revolucionado nuestra capacidad para evaluar las relaciones en muchos grupos, incluyendo helechos leptosporangiados, un gran clado bien soportado de plantas vasculares (Pryer & al., 2001a, 2004) se caracteriza por esporangios que desarrollarse a partir de una sola célula y tienen paredes maduros sólo unacélula de espesor.
Filogenética molecular incluyendo análisis de los taxones de marcador de posición representativas han revelado la composición, y las relaciones entre los principales linajes leptosporangiados (Hasebe y otros, 1993, 1994, 1995;. Pryer y otros, 1995, 2001a, 2004;. Wolf, 1996, 1997 ; Vangerow & al., 1999;. Schneider & al, 2004c; Wikström y Pryer, 2005;. Schuettpelz y otros, 2006).Densamente muestreado análisis dentro de algunos de estos grupos han dilucidado las asociaciones más detalladas y han proporcionado un marco filogenético para los estudios evolutivos más enfocados estrechamente-(véanse las referencias citadas en virtud de diversos grupos taxonómicos en la discusión). Sin embargo, ni el muestreo marcador de posición de diversos clados ni de muestreo denso dentro deun clado particular, es muy adecuado para abordar cuestiones evolutivas a gran escala a través de helechos leptosporangiados. Un enfoque más amplio es necesario.
El análisis más inclusivo de las relaciones Polypodiidae realizados hasta la fecha era el estudio de colaboración innovadora de Hasebe & al. (1995). Aunque este estudio ayudó a responder a muchas preguntas de larga data en la sistemáticade helechos (Smith, 1995), no fue sin problemas. Con cerca de 9.000 especies existentes en 267 géneros (Smith & al., 2006b), helechos leptosporangiados son, después de las angiospermas, el linaje más diverso de plantas vasculares. Sin embargo, la Hasebe & al. (1995) estudio muestreó sólo 99 especies de 92 géneros, con exclusión de casi dos tercios de los géneros Polypodiidae y undersampling todos,pero el más pequeño. Además, se basa en un solo gen plastidial (1206 pares de bases de rbcL), lo que resulta en niveles relativamente bajos de apoyo rama a través de la filogenia (sólo alrededor de la mitad de los nodos resueltos fueron apoyados por la máxima parsimonia o vecino unirse porcentajes de rutina de carga ≥ 70) .
Para obtener una mejor estimación en la muestra y mejor apoyado por el delas relaciones globales de helechos y avanzar un paso más cerca de una filogenia completa de helechos existentes, un conjunto de datos considerablemente mayor se reunió y analizó aquí. Se compone de 400 especies de 187 géneros leptosporangiados-más de 4% de las especies y más de dos tercios de los géneros (Smith & al., 2006b) -sampled en proporción al tamaño de linaje, para proporcionar unarepresentación más precisa y equilibrada del helecho árbol de la vida. Para cada especie, tres genes que codifican proteínas de plástidos se secuenciaron-total de más de 4000 pares de bases-a garantizar una filogenia bien apoyado. El análisis actual construye sobre el fundamento de los estudios anteriores para proporcionar un marco incomparable en el que examinar la evolución y diversificación dehelechos leptosporangiados, al mismo tiempo mejorar nuestra comprensión filogenética de este importante linaje.
Material y método
Muestreo taxonómico. - En los estudios filogenéticos, un enfoque estricto marcador de posición se utiliza a menudo (es decir, una sola especie se utiliza para representar cada género en los estudios intrafamiliares, un solo género se utiliza para representar cada familia...