Filogenetica

Clasificación filogenética y el árbol universal

W. Ford Doolittle
Del análisis comparativo de las secuencias de nucleótidos de genes que codifican ARN ribosomal y varias proteínas, filogeneticistas molecular han construido un "árbol universal de la vida", teniendo como elbase de un "natural" de clasificación jerárquica de todos los vivientes las cosas. A pesar de la confianza en algunas delas ramas de los árboles a principios Recientemente se ha sacudido, nuevos enfoques podría resolver muchos incertidumbres metodológicas. Más difícil es evidencia de que la mayoría de arqueas y genomas bacterianos (y deducir lo ancestral eucariotas genoma nuclear) contienen genes de múltiples fuentes. Si "la transferencia lateral de genes", "quimerismo" o no pueden ser despedidos tan trivial en mayoro menor medida se limite a categorías especiales de los genes, entonces no hay clasificación jerárquica universal puede ser tomado como naturales. filogeneticistas molecular se han podido encontrar el "Verdadero árbol," no porque sus métodos no son adecuados o porque que han elegido los genes equivocados, sino porque la historia de la vida no puede ser correctamente representado como unárbol. Sin embargo, las taxonomías sobre la base de secuencias moleculares siguen siendo indispensables, y la comprensión del proceso evolutivo en última instancia, no se verá enriquecido y empobrecido.
Instituto Canadiense de Investigación Avanzada del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular de la Universidad de Dalhousie, Halifax, Nueva Escocia B3H 4H7, Canadá. E-mail: ford@is.dal.ca 

Elimpulso para clasificar a los organismos es antigua, como es el deseo de que la clasificación refleje el "orden natural". Antes de Darwin, los biólogos pensaban que Dios o algún otro principio eterno creado por este orden ( 1 , 2 ). Después de Darwin ( 3 ), sabían que el principio ordenador para compartir la descendencia de una cada vez más limitado número de ancestros comunes ( Fig. 1. ) de nuevo alúltimo ancestro común de todos los seres vivos. Un filogenético clasificación es por lo tanto la única natural, y se debe "Inclusive jerárquica" ( 1 ): Cada especie debe ser parte de un género y sólo uno, cada género debe ser parte de una y sólo una familia, y así sucesivamente.

Fig. 1. Parte de la única figura en el origen de las especies. Darwin fue el primero que utiliza para representar a ladivergencia de las variantes de una misma especie, mostrando más diferencia, sucesivamente, en un único linaje (un 1 a un 10) y la división en múltiples linajes (m, s, i, etc), algunos de los cuales se ser nuevas especies. Más tarde, se amplía la metáfora del árbol, y explicó que "los miembros divididos en grandes ramas ... se fueron una vez, cuando el árbol era pequeño, ramas en ciernes, y estesentido de los brotes antiguos y actuales por las ramas se ramifican y pueden representar a la clasificación de todas las especies vivas y extinguidas en grupos subordinados a otros grupos "( 3 , p. 171).

Gran parte de la filogenética moderna filogenia molecular. filogeneticistas microbiana en particular dependen de secuencia molecular personajes, ya que los procariotas (bacterias y arqueas)ofrecen relativamente poco en el camino de la compleja morfología y comportamiento. Más allá de este consideración práctica es la comprensión de que las secuencias moleculares definir, en palabras de Zuckerkandl y Pauling, "la esencia del organismo "- no sólo los genes revelan el patrón filogenético, que generan y encarnan ( 4 ).
Desde 1965, cuando los argumentos a favor de la filogenia molecularfueron los primeros, transmisión de datos de secuencias de genes se han vuelto increíblemente abundante. Hoy en día, filogeneticistas moleculares parecen haberse dado cuenta de la esperanza de Darwin para un árbol filogenético universal ( 5 ), una clasificación jerárquica de los "grupos subordinados a otros grupos" que se remonta a los albores de la vida, cuando toda la vida era microbiana. Este...