Fisicoquimica

FISICOQUIMICA
La fuerza de diversas funciones potenciales presentada hasta ahora asumir las condiciones de equilibrio y por lo tanto, independiente del tiempo o de la tasa de aproximación oseparación de dos moléculas o superficies. Esto a menudo no es el caso, especialmente con las interacciones biológicas.
La resistencia de una unión aislado se puede esperar a ser dada por la fuerza máxima quepuede soportar sin romperse Fmax. Esto debe estar relacionado con la pendiente máxima de la energía potencial función E (D) por Fmax = (-dE/dD) max, como se ilustra en la figura. 16 (a). en unaartículo clásico escrito hace 20 años, Bell (1978) fue uno de los primeros en predecir ese vínculo fortalezas no sólo dependen de la energía de equilibrio o función de la fuerza, sino también en latemperatura y la escala de tiempo de la medición. Para apreciar esto, ® RST necesario considerar exactamente lo que ocurre cuando se rompe un enlace. Consideremos el simple potencial LR en la fig.
16 (b). Enausencia de una fuerza externa de tracción, debido a la energía térmica ambiente, hay una probabilidad finita de que algunos receptores y ligandos se adquieren energía suficiente para difundir sobrela Eact barrera de activación en Dts. Este último se puede suponer que se corresponden con la longitud del enlace de LR. La disociación se activa térmicamente y espontánea, es decir, que ocurre enausencia de una fuerza externa. El tiempo de vida vínculo intrínseco s! está dada por

donde v0 es la frecuencia de la vibración característica del enlace, es decir, la frecuencia de vibración delligando en el bolsillo receptor. Para un enlace típico v0 = E1011 s-1, de modo que si el bono (ecuación (25) se puede entender intuitivamente considerando el ligando que se oscilando en la pozo depotencial a una frecuencia determinada por su velocidad v media y la anchura w de la fianza. La velocidad está dada por relación energía cinética del ligando a la energía térmica

La figura. 16. El...