Genómica - Apuntes de Clase

Capitulo 8
8.1 – El Núcleo Eucariota
La subestructura nuclear es llamada Matriz Nuclear, compuesta por un una compleja red de
proteínas y fibrillas de RNA. La matriz permea la enteridad del núcleo, e incluye regiones
denominadas Andamios Cromosómicos (o Andamiaje Cromosomal). Los componentes de la matriz
nuclear están en constante movimiento.

8.1.2 – Los Dominios de la CromatinaHeterocromatina – Aquella que se encuentra empaquetada e indispuesta a la transcripción de sus
contenidos. Se divide en dos tipos…
Heterocromatina Constitutiva – Aquella compuesta por DNA no genético. Aquí vienen a
caer el material centromérico y telomérico. La mayor parte del cromosoma Y es heterocromatina
constitutiva.
Heterocromatina Facultativa – Es un estado no permanente de una fracción del DNAcodificante, esto se debe a que se trata de material transcrito únicamente durante ciertos
periodos en el desarrollo de la célula, o bien simplemente no es utilizado por el tipo de célula al
que pertenece.
Eucromatina – Regiones del genoma que son transcritas, estas por su morfología permiten el
acceso del sistema de transcripción a ellas. Presentan bucles de DNA con un largo de entre 40 y100 kb. Estos bucles se asocian a la matriz nuclear mediante regiones ricas en AT llamadas
Regiones Asociadas a la Matriz (MAR’s) o Regiones de Acoplamiento al Andamiaje (SAR’s).
Los bucles entre los MAR’s se llaman Dominios Estructurales y se cree que están relacionados a
los Dominios Funcionales. Estos últimos son determinados mediante un examen de las regiones
inmediatas a un gen (o unset de estos). Esto mediante un tratamiento de una región de cromatina
purificada con DNAsa I.

(Dominio Funcional en Región Sensible a DNAsa)

Los bordes de los dominios funcionales están marcados por la presencia de secuencias de 1-2 kb
de largo llamadas Insulators (Aislantes). Este tipo de secuencias fueron descubiertas por primera
vez en Drosophila, pero han sido descritos en un grannúmero de Eucariotas.
Specialized Chromatin Structure (scs) y scs’ son los más ampliamente estudiados. Se encuentran
ubicados a ambos lados de los dos genes hsp70.

Los Insulators poseen dos características principales en relación a su rol como delimitadores de
dominios funcionales.
 Capacidad de sobreponerse al efecto posicional de la inserción al azar.
 Capacidad de mantener independenciainter-dominal. (Existe esta palabra?)

(Insulators y el Efecto Posicional)

No se sabe a ciencia cierta aun como es que los insulators llevan al cabo sus funciones, pero se
cree que su capacidad de aislante es provista no tanto por su secuencia propiamente, sino por las
proteínas, como Su(Hw), que se unen específicamente a ellos. Estas proteínas también realizan
interacciones con la MatrizNuclear.
La formación y mantenimiento de un dominio funcional abierto, en algunos casos, es obra de los
LCR’s (Regiones de Control del Locus). Estas son secuencias de DNA que, como los Insulators, son
capaces de sobreponerse al efecto posicional. Sin embargo, a diferencia de estos últimos, los LCR’s
también estimulan la expresión de los genes contenidos en su dominio funcional.
Los LCR’sfueron por primera vez descubiertos en los genes de las ß-globinas, contenidos en un
segmento de 12 kb de longitud. Se piensa que los LCR’s deben sus funciones, al igual que los
Insulators, no tanto a sus secuencias propiamente, sino a las proteínas que se les unen.

8.2 – Modificaciones en la Estructura de la Cromatina & Expresión Genética
Los nucleosomas aparentemente son los determinantesprincipales de la actividad genómica en
los eucariotas. Su presencia o ausencia, y su estructura determinan el nivel de empaquetamiento
de la cromatina.
Las Histonas son capaces de sufrir un numero de modificaciones (Acetilaciones, metilaciones,
fosforilaciones, etc…) El tipo mejor estudiado es el de las acetilaciones…
La Acetilación en Histonas básicamente consiste en la adición de un grupo...