Gen Aoc Y Su Producto Proteico

Centro universitario de ciencias biológicas y agropecuarias CUCBA |
Biología molecular |
Informe de bioinformática |
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José Pablo López Ruvalcaba |
25/11/2012 |

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Informe debioinformática
Equipo 5
Secuencia 5
* Introducción
La secuencia problema fue comparada con una base de datos de un banco de germoplasma (Genbank), obteniendo como resultado una similitud de un99% con una secuencia de ARNm presente en la especie Hordeum vulgare (cebada) la cual codifica para la proteína allene oxide cyclase.
* Características del gen
Nombre: Gen AOC
Producto:aleno óxido ciclasa
Organismo: Hordeum vulgaria
Tipo de molécula: ARNm
Topología: lineal
Función: biosíntesis del acido jasmónico
Longitud de la secuencia: 920 pb
Locus:AJ308488
Cromosoma: 3

* Gráfico de comparación

Este ARNm es transcrito a partir de la secuencia de ADN que comprende el gen-AOC, el cual contiene la información para la síntesis de talproteína (allene oxide cyclase).

* Comparación entre la secuencia problema y la encontrada en genbank
Entre la secuencia problema y la secuencia encontrada en la base de datos se encontraron solocuatro diferencias:

* Nucleótidos 262 y 263 se sustituyeron 2 Guaninas por 2 citocinas (A)
* Nucleótidos 578 y 579 se sustituyeron 2 timinas por 2 citocinas (B)

* Consecuencias delcambio de bases
La función de las proteínas (en este caso de las enzimas) es altamente específica en relación con su estructura. El cambio de estos nucleótidos podría cambiar la estructuraterciaria de la proteína causando que tenga un mal funcionamiento o la perdida de su función.
Los aminoácidos que se modificaron fueron:
* Un ácido glutámico por una histidina; de un ácido con carganegativa a una base con carga positiva.
* Una glutamina por un ácido glutámico; de un aminoácido polar pero no cargado a uno acido con carga negativa.
* Una glicina por un fenilalanina; de un...